生物信息分析命令行-一些简单却易忘的小命令

1. 运行任务放后台，暂停任务放前台（任务在本地运行，由于需要关电脑，所以需要放到后台运行）：

ctrl+z #暂停

bg #将暂停任务后台运行

fg # 后台暂停的任务调前台

 

 2. 利用root权限添加新的账号。

useradd -d /home/new new # 添加账号

passwd new # 初始化密码

mkdir /home/new # 创建用户home目录

cp ~/{.b*,.v*,.d*} /home/new # 配置用户环境

chown new:new /home/new -R # 更改目录隶属

usermod # 分组

userdel # 删除用户

【问题】创建的new没法source环境

dpkg-reconfigure dash # 重新配置sh，选No，改dash 为 bash

 source ~/.bashrc # 登录新账号，重新source

  userdel -r new #删除新账号 # -f可强制删除

 apt install open-vm-tools 安装虚拟机tools （见官网帮助，不用找博客瞎指导）。

apt-get install  language-pack-zh-han* #安装中文语音包

3. windows汉语转linux汉语。

convmv ./* -f gb2312 -t utf8 --notest

4. 文件过多无法操作时

cat ./head > ./MtrunA17Chr0_Metru.maf.raw
find ./MtrunA17Chr0_Metru/ -name "*maf" | xargs cat | grep -v "#" >> MtrunA17Chr0_Metru.maf.raw
cat ../tail >> ../MtrunA17Chr0_Metru.maf.raw
python3 ../../call_CNB.py ../MtrunA17Chr0_Metru.maf.raw > ../MtrunA17Chr0_Metru.maf.raw.f
maf_sort ../MtrunA17Chr0_Metru.maf.raw.f Medicago_truncatula > ../MtrunA17Chr0_Metru.maf