05 2020 档案

Plink 估计标间LD情况及其结果文件处理

摘要：全基因组遗传标记位点的连锁不平衡估计阅读全文

posted @ 2020-05-25 08:53 疯子生信阅读(1925) 评论(2) 推荐(0) 编辑

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1. Re:基于遗传距离的方法构建系统进化树
处理完以后neighbor输入文件以后会出现 ERROR: diagonal element of row 1 of distance matrix is not zero. Is it a dist...
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2. Re:基于遗传距离的方法构建系统进化树
@w_dong_dong 把样本名补齐到10个字符，执行过这一步之后检查一下是不是10个字符了。awk '{print $2" "}' plink.mdist.id | cut -c1-10 > ID...
--晴一天
3. Re:基于遗传距离的方法构建系统进化树
处理完以后neighbor输入文件以后会出现 ERROR: diagonal element of row 1 of distance matrix is not zero. Is it a dist...
--w_dong_dong
4. Re:基于遗传距离的方法构建系统进化树
@岸芷汀兰2018 mdist 文件需要做相关的处理： Using the distance file between each individual to prepare Phylip input ...
--疯子生信
5. Re:Plink 估计标间LD情况及其结果文件处理
@养生answer 不需要保持一致，-ld-window-bp主要根据你自己的需求进行设定，没有一定的标准...
--疯子生信

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