DNA测序检测软件
1. Nanocall:一款适用于牛津纳米孔测序数据的开源基因序列分析软件,由David M, Dursi L J, Yao D等人于2017年发表在"生物信息学"期刊上。
2. DeepNano:一种基于深度递归神经网络的基因序列分析软件,适用于MinION纳米孔测序数据,由Boža V, Brejová B, Vinař T等人于2017年发表在"PloS one"期刊上。
3. Chiron:一种基于深度学习技术,直接将纳米孔原始信号转换为核苷酸序列的软件,由Teng H, Cao M D, Hall M B等人于2018年发表在"GigaScience"上。
4. Causalcall:一种基于时域卷积神经网络的基因测序分析软件,适用于纳米孔测序数据的碱基识别,由Zeng J, Cai H, Peng H等人于2020年发表在"Frontiers in genetics"期刊上。
5. DeepSignal:一种检测DNA甲基化状态的软件,适用于纳米孔测序数据,采用深度学习技术实现,由Ni P, Huang N, Zhang Z等人于2019年发表在"Bioinformatics"期刊上。
6. 对牛津纳米孔测序数据中的DNA碱基修饰进行检测的软件,采用深度递归神经网络算法,由Liu Q, Fang L, Yu G等人于2019年发表在"Nature communications"期刊上。
7. Brinkerhoff:采用纳米孔测序技术,可以将单个蛋白质进行多次重读测序,并获得单个氨基酸的分辨率,由Brinkerhoff H, Kang A S W, Liu J等人于2021年发表在"Science"期刊上。