摘要: 例如我有一列的内容是: A B A C D D A F 那么,我只想显示A和F所在的行 怎么实现? 答案: ”筛选“ 》”按文本筛选“ 》在”A“,”F“之前的方框打勾即可 阅读全文
posted @ 2020-04-22 14:43 YlnChen 阅读(1022) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 编写了几个Java类,反复检查多次代码没毛病 点击运行,却报错: Error:Internal error: (java.net.MalformedURLException) unknown protocol: jrt 上网搜寻到了原因: 看看你的jdk是否是14.0版本? intelliJ官网说1 阅读全文
posted @ 2020-04-22 10:32 YlnChen 阅读(4475) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 液体活检(Liquid biopsy)液体活检也称为液体活检或液相活检,是对非固体生物组织(主要是血液)的采样和分析。像传统的活检一样,这种类型的技术主要用作癌症等疾病的诊断和监测工具,其主要优点是无创。 因此,它也可以更频繁地完成,从而可以更好地跟踪一段时间内的肿瘤和突变。 通过在几周内进行多次液 阅读全文
posted @ 2020-04-21 14:08 YlnChen 阅读(4167) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: DNA测序(同义词:DNA深度测序| DNA高通量测序)包括全基因组测序(WGS),全外显子组测序(WES或WXS)和靶向测序。 WGS意味着对整个DNA基因组进行测序, 而WES专注于mRNA编码区(外显子)进行测序,而mRNA编码区(外显子)通常只占很小的基因组部分(在人类中为3%)。 尽管WG 阅读全文
posted @ 2020-04-20 11:25 YlnChen 阅读(9821) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: # genefuse# 手头有一批DNA数据,打算进行基因融合分析# Google搜罗一番,发现都是基于转录组RNA数据的# 好不容易找到一款基于DNA数据,genefuse!在GitHub,anaconda都有源代码包# 软件原网址:# https://github.com/OpenGene/ge 阅读全文
posted @ 2020-04-18 11:30 YlnChen 阅读(1495) 评论(1) 推荐(0) 编辑
摘要: # COSMIC? # (the Catalogue of Somatic Mutations in Cancer) database. # druggable?# 有药可靶向# undruggable:# 无药可靶向 # Curated?# 在很大程度上与“ manuallycurated”同义, 阅读全文
posted @ 2020-04-18 11:06 YlnChen 阅读(224) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: # 首先确定流程: # *.vcf(包含起始位点,染色体) > *.annotated.vcf(包含基因名称) # 通过流程可知: # 我们需要bed文件。因为bed文件包含: # 染色体序号,起,止位点,基因的symbol # 确定好流程之后,我们开始搜寻需要的资料。 # 一个忠告:一定去Goog 阅读全文
posted @ 2020-04-16 14:12 YlnChen 阅读(2630) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: # vep # 使用vep对manta结果进行注释 # manta结果是染色体结构变异(SV),这里使用vep进行注释 # vep官方说明文档: # http://asia.ensembl.org/info/docs/tools/vep/script/vep_tutorial.html # 安装 c 阅读全文
posted @ 2020-04-16 10:17 YlnChen 阅读(31896) 评论(4) 推荐(3) 编辑
摘要: # 非root用户安装perl5在用户目录: wget https://www.cpan.org/src/5.0/perl-5.30.2.tar.gz tar -zxvf perl-5.30.2.tar.gz sh Configure -des -Dprefix=/home/yiln \ # 设置用 阅读全文
posted @ 2020-04-16 10:04 YlnChen 阅读(538) 评论(1) 推荐(0) 编辑
摘要: 1、编写hello world脚本 #!/bin/bash echo "Hello World!" 2、通过位置变量创建 Linux 系统账户及密码 #!/bin/bash useradd "$1" echo "$2" | passwd ‐‐stdin "$1" #$1 是传给脚本的第一个参数,$2 阅读全文
posted @ 2020-04-15 18:00 YlnChen 阅读(3701) 评论(0) 推荐(0) 编辑