08 2022 档案
摘要：只想留下一些特定的行： 1用df2.index把index(行名)设置好 2用list1承装想留下的行名 3： df3 = df2[df2.index.isin(list1)] df3就是筛选过的新表 4：按list对df3进行排序： df4 = df3.reindex(list1)
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摘要：import os import pandas as pd import numpy as np path =r"/**/**/**" #填上文件所在的目录 file_name = [] frames = [] for root,dirs,files in os.walk(path): #遍历根目录
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摘要：按esc键进入 Normal Mode： 键盘直接输入：ggvGJ gg 用于跳到行首 v 转换成 visual 模式 G 跳到最后一行 J 合并行
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摘要：#!/usr/bin/env python import seaborn as sns import matplotlib.pyplot as plt import pandas as pd import sys import os outdir=sys.argv[1] depthfile=os.p
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摘要：文字版： #!/usr/bin/env python # coding=gbk ##暗反应5，6cycle需要去除第5，6个碱基和他们的质量值## ##必须放在输出文件夹路径下运行，参数1是原始fq.gz文件，参数2是截取后fq.gz文件## ##命令行输入示例：python TrimBase.py
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摘要：在vim按shift+enter键，进入命令模式，然后输入：%s/\r//g
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摘要：cat 1.txt | awk -v OFS="_" '{split($0,a,"/" ); print a[1], a[2]}'
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摘要：查看项目 monitor stat 查看项目报错信息 monitor stat -p PROJECTID_BWA -m 3|grep fail
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摘要：在利用while read line读取文件时： 如果文件最后一行之后没有换行符\n，则read读取最后一行时遇到文件结束符EOF，循环即终止。 虽然，此时$line内存有最后一行，但程序已经没有机会再处理此行内容。因此导致了这个问题发生。解决方案如下： 1 cat $2 | while read
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摘要：if语句一定要有空格！否则你写正确了也会认为是一个错误命令 if[$STR1=$STR2](错误写法) if [ $STR1 = $STR2 ](正确写法) if语句中如果不添加空格的话，"if["会被识别为一个未知的命令，在运行时就会报错："command not found"，添加正确的空格才能
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摘要：#!/usr/bin/bashFolder_A=`pwd` cd $Folder_Afor file_a in ${Folder_A}/*do filepath=`basename $file_a` if [[ ${filepath:0-3:3} -eq "txt" ]] ##以txt文件为例##t
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摘要：循环读入很好写，可是每一行作为参数直接传给程序会报错，因为末尾有换行符 此时把换行符删除即可正常运行： cat fq.txt | while read linedo path=$(echo $line | sed 's/\r//') ##这一步就是替换每一行的换行符##samtools view $
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摘要：awk '$1==1&&$2~/^14/' test.csv |awk '{sum+=$3}END{print "Average = ", sum/NR}' $1,$2,$3代表第一，二，三列 awk '$1==1&&$2~/^14/' test.csv 找出了第一列精准匹配=1，第二列模糊匹配以1
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摘要：syntax error near unexpected token `done’运行脚本文件出现syntax error near unexpected token `done’的问题 搜索发现很多答案给出的都是win 和linux 编码解码问题如果是编码问题用方案1解决 ： 脚本如下：#!/bi
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