07 2022 档案
摘要:首先 nextflow很多函数和语句和Java是一样的,基于Java构建 nextflow学习手册:https://www.nextflow.io/docs/latest/script.html 有非常详尽的nextflow语法教学 第一个问题:为什么运行nextflow之后work文件夹全部是一样
阅读全文
摘要:#只提取fq.gz文件的前1000行形成一个新文件(更少的数据量会让测试跑得更快) zcat V350100615_noHED_B_L01_9_2.fq.gz |head -n 1000 |gzip -> less.fq.gz
阅读全文
摘要:https://github.com/nf-core/rnaseq/tree/master/docs
阅读全文
摘要:json 对象,顾名思义,就知道它是一个对象。里面的 key 就是对象的属性。我们要访问一个对象的属性,只需要使 用【对象名.属性名】的方式访问即可
阅读全文
摘要:如下三种方法来设置环境变量: 1、直接用export命令:(临时) export PATH=$PATH:/opt/tools/bin 可用命令export查看 2、修改profile文件:(永久) 在文件中加入:export PATH="$PATH:/opt/tools/bin" 执行:. /etc
阅读全文
摘要:1、$_ 是默认参数的意思,指的是在不指定的情况下,程序处理的上一个变量,比如: open(IN,"<file.txt") while(<IN>) { print $_; } close(IN); 这个例子是打开一个文本文件,读取每一行,在没有指定参数的情况下,$_指向了从文件中读取的每一行。 2、
阅读全文