摘要: # 首先确定流程: # *.vcf(包含起始位点,染色体) > *.annotated.vcf(包含基因名称) # 通过流程可知: # 我们需要bed文件。因为bed文件包含: # 染色体序号,起,止位点,基因的symbol # 确定好流程之后,我们开始搜寻需要的资料。 # 一个忠告:一定去Goog 阅读全文
posted @ 2020-04-16 14:12 YlnChen 阅读(2630) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: # vep # 使用vep对manta结果进行注释 # manta结果是染色体结构变异(SV),这里使用vep进行注释 # vep官方说明文档: # http://asia.ensembl.org/info/docs/tools/vep/script/vep_tutorial.html # 安装 c 阅读全文
posted @ 2020-04-16 10:17 YlnChen 阅读(31896) 评论(4) 推荐(3) 编辑
摘要: # 非root用户安装perl5在用户目录: wget https://www.cpan.org/src/5.0/perl-5.30.2.tar.gz tar -zxvf perl-5.30.2.tar.gz sh Configure -des -Dprefix=/home/yiln \ # 设置用 阅读全文
posted @ 2020-04-16 10:04 YlnChen 阅读(538) 评论(1) 推荐(0) 编辑