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随笔分类 -  医学影像处理与计算

[Medical Image] 利用VTK和PyQt5对医学体数据进行渲染并展示
摘要：[Medical Image] 利用VTK和PyQt5对医学体数据进行渲染并展示本文简单介绍一下，如何利用PyQt5和VTK来渲染体数据（三维数据），并集成进PyQt的UI框架中。 阅读全文
posted @ 2022-05-04 19:34 芒果和小猫 阅读(3058) 评论(1) 推荐(1) 编辑
[Medical Image] 医学图像处理中的数据读写
摘要：医学图像处理中的数据读写 常见的医学图像的格式 不管格式如何变化，对于医学图像而言，最终读取到内容中的数据就是图像的强度值信息，就类似自然图像的RGB表示法一样。这里叫做强度值，因为不同的医学图像例如CT、MRI他们可区分的信号的范围和一般自然图像不一样。一般自然图像256个级别就够用了，而医学图像 阅读全文
posted @ 2022-03-12 17:26 芒果和小猫 阅读(2354) 评论(0) 推荐(0) 编辑
[Medical Image] 皮肤镜图片毛发去除
摘要：1 皮肤镜毛发去除的目的 根据皮肤镜图片对皮肤病变种类进行分类是一个常规的研究话题，在深度学习时代，会将标注好的数据进行训练，学习皮肤病变的特征，而图片中常常会有毛发干扰，这是我们不需要的特征，也不希望网络学习到这个特征，因此在数据预处理阶段，可以使用一些传统图像处理算法对图像进行处理。 代码在仓库 阅读全文
posted @ 2019-12-24 00:02 芒果和小猫 阅读(2395) 评论(0) 推荐(0) 编辑
[Medical Image] 胸部CT提取分割肺部
摘要：1. 肺部分割提取简介 在处理胸部CT时，我们常常需要获取肺部的一个mask，也就是将肺部结构从数据中提取出来。二维图像还好说，但是三维图像就会变得复杂复杂一点。肺部的分割常常做后续操作的预处理，所以有必要提取提取一个肺部的mask，来辅助后面的操作，所以这里利用传统图像处理方法来提取了一下肺部，当 阅读全文
posted @ 2019-12-13 22:24 芒果和小猫 阅读(6368) 评论(3) 推荐(4) 编辑
[Medical Image] 医学影像重采样
摘要：1. 重采样 在医学图像预处理的过程中，常常需要对数据进行重采样，采样到我们需要的尺度。因为医学图像是和真实空间的物理尺寸相对应的。例如一个体素的大小是0.97mm 0.97mm 2.5mm，我们想将体素块的大小采样到1mm 1mm 1mm，这样可以帮助我们进行下一步处理。利用 sitk 可以完成这 阅读全文
posted @ 2019-12-08 19:28 芒果和小猫 阅读(3689) 评论(3) 推荐(0) 编辑
[Medical Image] 图像中用到的信息论中的一些概念公式
摘要：1 熵 1.1 香农熵（Shannon Entropy） 用来描述信息量的多少,随机变量不确定性的度量（metric），给定一个随机变量X,p(x)=PrX=x,x∈ω H(X)=−∑x∈ωp(x)log2p(x) 1.2 联合熵（ 阅读全文
posted @ 2019-11-22 19:22 芒果和小猫 阅读(1064) 评论(0) 推荐(1) 编辑
[Medical Image] raw文件转mha文件
摘要：raw格式 在体数据（volume）中，经常会遇到raw文件，raw文件就是其实就是所有体素组成的文件，raw文件必须还有一些描信息才能用（因为得知道数据的size，type，spacing等），就像.mhd文件是对raw文件的一个描述。在医学数据处理中，经常使用mha文件格式来对数据进行处理，因为 阅读全文
posted @ 2019-11-12 23:47 芒果和小猫 阅读(802) 评论(0) 推荐(0) 编辑
[Medical Image] mha格式的CT体数据转为jpg切片
摘要：mha格式的CT体数据转为jpg切片 mha格式 .mha文件是一种体数据的存储格式，由一个描述数据的头和数据组成，一般我们拿到的原始医学影像的数据是.dcm也就是dicom文件，dicom文件很复杂包含了各种各样的标签，通常我们只关心dicom里的影像信息，所以一般会把多个dicom切片转成一个文 阅读全文
posted @ 2019-11-08 12:18 芒果和小猫 阅读(4241) 评论(9) 推荐(0) 编辑

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