摘要: Docker 创建镜像 本文作者:Sunny-King 发布时间:2022-07-30 12:55:35 星期六 本文链接:https://www.cnblogs.com/Sunny-King/p/Tools-Docker_images.html 最近由于工作需要,学习了Docker的一些基础知识。 阅读全文
posted @ 2022-07-30 12:56 Sunny-King 阅读(18967) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Bam sort问题 本文作者:Sunny-King 发布时间:2022-07-22 本文链接:https://www.cnblogs.com/Sunny-King/p/Bioinformatics-Bam_sort.html 将两个bam文件合并到一块后发现Tag标签顺序不一致,回顾发现排序软件在 阅读全文
posted @ 2022-07-23 20:27 Sunny-King 阅读(19042) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 基于下一代测序数据的微卫星不稳定性检测新算法 A Novel Algorithm for Detecting Microsatellite Instability Based on Next-Generation Sequencing Data Li S, Wang B, Chang M, Hou 阅读全文
posted @ 2022-07-22 18:47 Sunny-King 阅读(18851) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Bam文件 本文作者:Sunny-King 发布时间:2022-07-14 本文链接:https://www.cnblogs.com/Sunny-King/p/Bioinformatics-Bam.html 在处理NGS下机数据时,通常会涉及到比对结果的查看,这需要对比对后的文件比较熟悉,下游的分析 阅读全文
posted @ 2022-07-14 14:56 Sunny-King 阅读(20222) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: Trimmomatic安装和使用 本文作者:Sunny-King 发布时间:2022-06-14 本文链接:https://www.cnblogs.com/Sunny-King/p/Bioinformatics-Trimmomatic.html 2022-06-14 Trimmomatic: A f 阅读全文
posted @ 2022-06-16 18:03 Sunny-King 阅读(32523) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: FastQC的安装与使用 FastQC的安装与使用 本文作者:Sunny-King 发布时间:2022-06-09 本文链接:https://www.cnblogs.com/Sunny-King/p/Bioinformatics-FastQC.html 一、下载安装 1、准备工作 java环境 FastQC是一个java应用 阅读全文
posted @ 2022-06-09 14:23 Sunny-King 阅读(22620) 评论(1) 推荐(1) 编辑
摘要: Conda安装与环境配置 本文作者:Sunny-King 发布时间:2022-06-06 修改时间:2022-08-11 本文链接:https://www.cnblogs.com/Sunny-King/p/Bioinformatics-Conda.html 在做生信软件测试和相关流程开发时会遇到软件 阅读全文
posted @ 2022-06-06 09:47 Sunny-King 阅读(20629) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: TransVar网页版使用 本文作者:Sunny-King 发布时间:2022-06-02 本文链接:https://www.cnblogs.com/Sunny-King/p/Bioinformatics-TransVar_web.html Transvar是一个基因变异位点的多功能注释软件,之前已 阅读全文
posted @ 2022-06-02 10:33 Sunny-King 阅读(19188) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: CNVind:一个基于开源云的管道,基于覆盖深度,在全外显子组测序数据中检测罕见的CNVs CNVind: an open source cloud‑based pipeline for rare CNVs detection in whole exome sequencing data based 阅读全文
posted @ 2022-06-01 18:15 Sunny-King 阅读(18956) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: #文献列表 CNV 文献阅读《CNVind: an open source cloud‑based pipeline for rare CNVs detection in whole exome sequencing data based on the depth of coverage》 MSI 阅读全文
posted @ 2022-06-01 18:15 Sunny-King 阅读(18848) 评论(0) 推荐(0) 编辑