MySQL的安装与启动

本文作者：Sunny-King

发布时间：2023-03-07 17:55:33 星期二

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最近在做一个关于注释和证据汇总的工作，其中涉及到基因ID、转录本ID、HGVS等信息，由于历史原因和不同数据库来源的原因，造成诸多不便。考虑利用MySQL来汇总关于基因和转录本的信息，便于后期查询。记录下学习过程和踩过的诸多坑。

一、下载镜像

为了便于安装和使用，避免其中的诸多权限问题，采用Docker的方式。首先从官网下载mysql的镜像，这里使用mysql:5.7版本的镜像文件。

# 从镜像源拉取mysql:5.7版本的镜像
$ docker pull mysql:5.7
# 查看镜像
$ docker images |grep mysql
mysql latest 70325c69f1fe 6 months ago 447MB
mysql 5.7 daff57b7d2d1 6 months ago 430MB
# 出现上述提示证明已经成功下载镜像

二、启动容器

提前配置mysql启动的默认项，在宿主机新建一个路径用以存储数据库的物理文件，并新建文件my.cnf作为mysql初始化配置项。

#在宿主机新建路径，当前路径为${workdir}
mkdir -p mysql/data
# 新建配置文件，并编辑配置项
cd mysql
touch my.cnf
vi my.cnf
# 在文件中插入下面的配置项
"""
[mysql]
#设置mysql客户端默认字符集
default-character-set=UTF8MB4
[mysqld]
#设置默认时区
default-time_zone='+8:00'
#设置3306端口
port=3306
#允许最大连接数
max_connections=200
#允许连接失败的次数
max_connect_errors=10
#默认使用“mysql_native_password”插件认证
default_authentication_plugin=mysql_native_password
#服务端使用的字符集默认为8比特编码的latin1字符集
character-set-server=UTF8MB4
#开启查询缓存
explicit_defaults_for_timestamp=true
#创建新表时将使用的默认存储引擎
default-storage-engine=INNODB
#等待超时时间秒
wait_timeout=60
#交互式连接超时时间秒
interactive-timeout=600
"""

利用docker启动容器

# 启动容器并挂载相应的目录
# 同步指定了mysql的root账户密码${PASSWORD}
docker run -d \
	-p 33060:3306 \
	-v ${workdir}/mysql/data:/var/lib/mysql \
	-v ${workdir}/mysql/my.cnf:/etc/mysql/conf.d/my.cnf \
	-e MYSQL_ROOT_PASSWORD=${PASSWORD} \
	--name ${CONTAINER_NAME} \
	mysql:5.7

# 查看容器的ID和名字，确认是否正确启动
docker ps |grep mysql
bebe3bcaf304   mysql:5.7 "docker-entrypoint.s…" 1 hours ago   Up 43 hours   33060/tcp, 0.0.0.0:33060->3306/tcp, :::33060->3306/tcp   ${CONTAINER_NAME}

三、进入容器开启远程访问

# 根据上一步查询到的容器名字或者ID进入容器
docker exec -it ${CONTAINER_NAME} bash
# 以root账户登录mysql
mysql -uroot -p${PASSWORD}
# 进入下面页面则证明mysql正确安装并启动
mysql>

如果需要远程访问mysql还需开启远程访问权限，进入容器，并登录mysql

# 添加远程登录权限，%表示可以从任意IP登录
mysql> alter user 'root'@'%' identified with mysql_native_password by '${PASSWORD}'';
Query OK, 0 rows affected (0.00 sec)

mysql> flush privileges;
Query OK, 0 rows affected (0.00 sec)