【转&改进】Linux MPI 单机配置
MPI的全称是Message Passing Interface即标准消息传递界面,可以用于并行计算。MPI有多种实现版本,如MPICH, CHIMP以及OPENMPI。这里我们采用MPICH版本。
一、MPICH安装
下载:http://www.mpich.org/static/downloads/3.0.4/mpich-3.0.4.tar.gz
tar -xzvf soft/mpich-3.0.4.tar.gz
cd mpich-3.0.4/
./configure --prefix=/usr/local/mpich
make && make install
这里提示权限不够,用
chmod 777 /usr/local
安装后加入环境变量/etc/profile,并执行 source /etc/profile
PATH=$PATH:/usr/local/mpich/bin
MANPATH=$MANPATH:/usr/local/mpich/man
export PATH MANPATH
二、单节点测试
复制源代码包下的examples目录到安装目录下
cp -r examples/ /usr/local/mpich
执行
mpirun -np 10 ./examples/cpi
输出结果如下:
Process 0 of 10 is on server150
Process 9 of 10 is on server150
Process 1 of 10 is on server150
Process 4 of 10 is on server150
Process 5 of 10 is on server150
Process 7 of 10 is on server150
Process 2 of 10 is on server150
Process 3 of 10 is on server150
Process 6 of 10 is on server150
Process 8 of 10 is on server150
pi is approximately 3.1415926544231256, Error is 0.0000000008333325
wall clock time = 0.020644如果我们现在想编译文件: 在/home/houqingdong下执行: mpicc -o hello hello.c 这时候会提醒:-bash:mpicc command not found 这是因为我们还没有配置路径
在命令行下输入: export PATH=/home/houqingdong/mpiexe/bin:$PATH 注意:这里仅仅是暂时的设置路径,在重启后效果会消失,如果想一劳永逸的配置,请google查询
看一下我们配置是否成功可以执行一下 echo $PATH 看一下输出结果中是否有我们的路径
这里不知道为什么运行计算PI 的程序会只有执行了一个进程,
手动编译范例下面的hellow范例,这次是正确的
问了博士助教,最后检查出来是因为下载的文件中自带的编译后的可执行程序是错的
用mpicc -0 cpi cpi.c
再编译一次就好了