bam-readcount 的安装

安装 bam-readcount

bam-readcount

需要提前安装 git 和 cmake
如果都没有安装的话，可以一条命令：

	$ sudo apt-get install build-essential git-core cmake zlib1g-dev libncurses-dev patch

用 git 来下载 bam-readcount

	$ git clone --recursive git://github.com/genome/bam-readcount.git
	这样就把 bam-readcount 下载到当前目录下，是一个文件夹

编译安装

	$ cd /home/user/bam-readcount
	$ cmake /home/user/bam-readcount/
	$ make

这样就完成了，在 bam-readcount/ 下 会出现一个 bin/ 目录，里面就是 可运行的 bam-readcount 文件，所以加到PATH中即可

	$ export PATH=/home/user/bam-readcount/bin:$PATH

测试

	$ bam-readcount

应该就看到各种信息，包括版本，基本用法等，这样 bam-readcount 就算安装完成了。