POJ1080
跟最长公共子序列很像
1 #include <iostream> 2 #include <cstdio> 3 #include <string.h> 4 using namespace std; 5 char a[105],b[105]; 6 int dp[105][105]; 7 char s[8]="ACGT-"; 8 int score[5][5]={ 9 { 5, -1, -2, -1, -3 }, 10 { -1, 5, -3, -2, -4 }, 11 { -2, -3, 5, -2, -2 }, 12 { -1, -2, -2, 5, -1 }, 13 { -3, -4, -2, -1, 0 } 14 }; 15 int getn(char c){ 16 for(int i=0;i<5;i++){ 17 if(s[i]==c)return i; 18 } 19 } 20 int main(){ 21 int t,x,y; 22 scanf("%d",&t); 23 while(t--){ 24 scanf("%d",&x); 25 scanf("%s",a+1); 26 scanf("%d",&y); 27 scanf("%s",b+1); 28 dp[0][0]=0; 29 for(int i=1;i<=x;i++)dp[i][0]=score[getn(a[i])][4]+dp[i-1][0]; 30 for(int i=1;i<=y;i++)dp[0][i]=score[4][getn(b[i])]+dp[0][i-1]; 31 for(int i=1;i<=x;i++){ 32 for(int j=1;j<=y;j++){ 33 int temp1=dp[i-1][j-1]+score[getn(a[i])][getn(b[j])]; //相当于LCS的a[i]=b[j]; 34 35 int temp2=dp[i][j-1]+score[4][getn(b[j])]; //相当于 a[i] '-' 匹配 36 // b[j-1] b[j] 37 38 int temp3=dp[i-1][j]+score[getn(a[i])][4]; //相当于 a[i-1] a[i] 匹配 39 // b[jj] '-' 40 dp[i][j]=max(temp1,max(temp2,temp3)); 41 } 42 } 43 printf("%d\n",dp[x][y]); 44 } 45 return 0; 46 }
