西游东行

摘要： 本文首发于微信公众号 *“ 生信补给站 ” ，期待您的关注！！！* 原文链接：https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIyNDI1MzgzOQ==&mid=2650394184&idx=1&sn=11f28193202b0714aadef44f5304eb9d&chks 阅读全文

摘要： 本文转载自微信公众号 “生信补给站”，https://mp.weixin.qq.com/s/41iKTulTwGcY-dHtqqSnLA 多个图形进行组图展示，可以既展示一个“事情”的多个角度，也可以进行异同的比较，同时也是发表论文所必须的。 可以利用PS或者AI进行处理，但是图形的大小，位置，布局 阅读全文

摘要： 初步接触数据集，探索性分析后，经常需要做一个相关分析，得到各变量间的相关系数以及显著性水平。 本文介绍一下R-corrplot包进行相关可视化展示。 一 数据准备 载入所需的R包，利用公共数据集mtcars进行展示。 二 相关系数展示 2.1 默认参数展示 2.2 更该形状和显示范围 method, 阅读全文

摘要： 热图可以聚合大量的数据，并可以用一种渐进色来优雅地表现，可以很直观地展现数据的疏密程度或频率高低。 本文利用R语言 pheatmap 包从头开始绘制各种漂亮的热图。参数像积木，拼凑出你最喜欢的热图即可，如下图： 基因和样本都可以单独聚类，排序，聚类再分组，行列注释，配色调整，调整聚类线以及单元格的宽 阅读全文

摘要： 火山图（Volcano Plot）常用于展示基因表达差异的分布，横坐标常为Fold change（倍数），越偏离中心差异倍数越大;纵坐标为P值（P值），值越大差异越显着。原因得名也许的英文因为查询查询结果图像火山吧 一载入R函数包及数据集 二ggplot2绘制火山图 2.1绘制简单的火山图 - 点图 阅读全文