2019年10月14日

R-forestplot包| HR结果绘制森林图

摘要: 本文首发于“生信补给站”微信公众号,https://mp.weixin.qq.com/s/2W1W-8JKTM4S4nml3VF51w 更多关于R语言,ggplot2绘图,生信分析的内容,敬请关注小号,给您干货。 上一篇简单的介绍了COX生存分析结果绘制森林图Forest plot(森林图) | C 阅读全文

posted @ 2019-10-14 22:45 生信补给站 阅读(12393) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2019年10月8日

Forest plot(森林图) | Cox生存分析可视化

摘要: 本文首发于“生信补给站”微信公众号,https://mp.weixin.qq.com/s/2W1W-8JKTM4S4nml3VF51w 更多关于R语言,ggplot2绘图,生信分析的内容,敬请关注小号,给您干货。 Meta分析的结果使用森林图进行可视化展示很常见,其实COX生存分析也能用森林图展示。 阅读全文

posted @ 2019-10-08 22:47 生信补给站 阅读(6644) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2019年9月25日

Nomogram(诺莫图) | Logistic、Cox生存分析结果可视化

摘要: 本文首发于“生信补给站”公众号,https://mp.weixin.qq.com/s/BWpy3F-nEKXCdVXmY3GYZg 当然还有更多R语言,生物信息学相关知识。。。🤭 Nomogram,也常称为诺莫图或者列线图,在医学领域的期刊出现频率越来愈多,常用于评估肿瘤学和医学的预后情况,可将L 阅读全文

posted @ 2019-09-25 09:28 生信补给站 阅读(8096) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2019年9月19日

R|批量循环处理同一格式文件-csv,txt,excel

摘要: 本文首发于“生信补给站”微信公众号,https://mp.weixin.qq.com/s/8IfMrSr9xc8_1Y2_9Ne6hg 在一个文件夹下有很多字段一致,格式统一的数据文件(csv,txt,excel),可以使用R快速的统一成一个文件方便后续分析和处理。 数据准备 将需要处理的字段一致, 阅读全文

posted @ 2019-09-19 10:12 生信补给站 阅读(2406) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2019年9月16日

maftools|TCGA肿瘤突变数据的汇总,分析和可视化

摘要: 本文首发于公众号“生信补给站”,https://mp.weixin.qq.com/s/WG4JHs9RSm5IEJiiGEzDkg 之前介绍了使用maftools | 从头开始绘制发表级oncoplot(瀑布图) R-maftools包绘制组学突变结果(MAF)的oncoplot或者叫“瀑布图”,以 阅读全文

posted @ 2019-09-16 23:19 生信补给站 阅读(7822) 评论(3) 推荐(0) 编辑

2019年9月10日

ggalluvial|TCGA临床数据绘制桑基图(Sankey)

摘要: 本文首发于”生信补给站“,https://mp.weixin.qq.com/s/yhMgkST-rVD6SaQS7R-eoA 桑基图(Sankey diagram),是一种特定类型的流程图,图中延伸的分支的宽度对应数据流量的大小,通常应用于能源、材料成分、金融等数据的可视化分析。 因1898年Mat 阅读全文

posted @ 2019-09-10 23:25 生信补给站 阅读(5158) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2019年9月3日

maftools | 从头开始绘制发表级oncoplot(瀑布图)

摘要: 本文首发于微信公众号 **“ 生信补给站 ”** ,期待您的关注!!! 原文链接:https://mp.weixin.qq.com/s/G-0PtaoO6bYuhx_D_Rlrlw 对于组学数据的分析和展示来说,maftools算是一个宝藏“R包”,可用于MAF格式的组学数据的汇总,分析和可视化展示 阅读全文

posted @ 2019-09-03 10:36 生信补给站 阅读(7883) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2019年8月27日

ggplot2|theme主题设置,详解绘图优化-“精雕细琢”-

摘要: 本文首发于“生信补给站”公众号,https://mp.weixin.qq.com/s/hMjPj18R1cKBt78w8UfhIw 学习了ggplot2的基本绘图元素ggplot2|详解八大基本绘图要素,可以初步绘制出需要展示的图形,legend可以对图例进行细节的修改ggplot2 |legend 阅读全文

posted @ 2019-08-27 13:54 生信补给站 阅读(2982) 评论(0) 推荐(0) 编辑

ggplot2|theme主题设置,详解绘图优化-“精雕细琢”

摘要: 本文首发于“生信补给站”公众号,https://mp.weixin.qq.com/s/hMjPj18R1cKBt78w8UfhIw 学习了ggplot2的基本绘图元素ggplot2|详解八大基本绘图要素,可以初步绘制出需要展示的图形,legend可以对图例进行细节的修改ggplot2 |legend 阅读全文

posted @ 2019-08-27 13:53 生信补给站 阅读(12711) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2019年8月20日

ggplot2 |legend参数设置,图形精雕细琢

摘要: 本文首发于微信公众号“生信补给站”,https://mp.weixin.qq.com/s/A5nqo6qnlt_5kF3_GIrjIA 学习了ggplot2|详解八大基本绘图要素后,就可以根据自己的需要绘制图形。前面也给出了一些ggplot2绘制生信分析基本图形的例子 pheatmap|暴雨暂歇,“ 阅读全文

posted @ 2019-08-20 11:35 生信补给站 阅读(8828) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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