西游东行

摘要： 初步接触数据集，探索性分析后，经常需要做一个相关分析，得到各变量间的相关系数以及显著性水平。 本文介绍一下R-corrplot包进行相关可视化展示。 一 数据准备 载入所需的R包，利用公共数据集mtcars进行展示。 二 相关系数展示 2.1 默认参数展示 2.2 更该形状和显示范围 method, 阅读全文

摘要： 热图可以聚合大量的数据，并可以用一种渐进色来优雅地表现，可以很直观地展现数据的疏密程度或频率高低。 本文利用R语言 pheatmap 包从头开始绘制各种漂亮的热图。参数像积木，拼凑出你最喜欢的热图即可，如下图： 基因和样本都可以单独聚类，排序，聚类再分组，行列注释，配色调整，调整聚类线以及单元格的宽 阅读全文