使用graphviz绘图 【转】
原文:http://icodeit.org/2012/01/%E4%BD%BF%E7%94%A8graphviz%E7%BB%98%E5%88%B6%E6%B5%81%E7%A8%8B%E5%9B%BE/
前言
日常的开发工作中,为代码添加注释是代码可维护性的一个重要方面,但是仅仅提供注释是不够的,特别是当系统功能越来越复杂,涉及到的模块越来越多的时候,仅仅靠代码就很难从宏观的层次去理解。因此我们需要图例的支持,图例不仅仅包含功能之间的交互,也可以包含复杂的数据结构的示意图,数据流向等。
但是,常用的UML建模工具,如VISIO等都略显复杂,且体积庞大。对于开发人员,特别是后台开发人员来说,命令行,脚本才是最友好的,而图形界面会很大程度的限制开发效率。相对于鼠标,键盘才是开发人员最好的朋友。
graphviz简介
本文介绍一个高效而简洁的绘图工具graphviz。graphviz是贝尔实验室开发的一个开源的工具包,它使用一个特定的DSL(领域特定语言):dot作为脚本语言,然后使用布局引擎来解析此脚本,并完成自动布局。graphviz提供丰富的导出格式,如常用的图片格式,SVG,PDF格式等。
graphviz中包含了众多的布局器:
- dot 默认布局方式,主要用于有向图
- neato 基于spring-model(又称force-based)算法
- twopi 径向布局
- circo 圆环布局
- fdp 用于无向图
graphviz的设计初衷是对有向图/无向图等进行自动布局,开发人员使用dot脚本定义图形元素,然后选择算法进行布局,最终导出结果。
首先,在dot脚本中定义图的顶点和边,顶点和边都具有各自的属性,比如形状,颜色,填充模式,字体,样式等。然后使用合适的布局算法进行布局。布局算法除了绘制各个顶点和边之外,需要尽可能的将顶点均匀的分布在画布上,并且尽可能的减少边的交叉(如果交叉过多,就很难看清楚顶点之间的关系了)。所以使用graphviz的一般流程为:
- 定义一个图,并向图中添加需要的顶点和边
- 为顶点和边添加样式
- 使用布局引擎进行绘制
一旦熟悉这种开发模式,就可以快速的将你的想法绘制出来。配合一个良好的编辑器(vim/emacs)等,可以极大的提高开发效率,与常见的GUI应用的所见即所得模式对应,此模式称为所思即所得。比如在我的机器上,使用vim编辑dot脚本,然后将F8映射为调用dot引擎去绘制当前脚本,并打开一个新的窗口来显示运行结果:
对于开发人员而言,经常会用到的图形绘制可能包括:函数调用关系,一个复杂的数据结构,系统的模块组成,抽象语法树等。
基础知识
graphviz包含3中元素,图,顶点和边。每个元素都可以具有各自的属性,用来定义字体,样式,颜色,形状等。下面是一些简单的示例,可以帮助我们快速的了解graphviz的基本用法。
第一个graphviz图
比如,要绘制一个有向图,包含4个节点a,b,c,d。其中a指向b,b和c指向d。可以定义下列脚本:
digraph abc{ a; b; c; d; a -> b; b -> d; c -> d; }
使用dot布局方式,绘制出来的效果如下:
图 1
默认的顶点中的文字为定义顶点变量的名称,形状为椭圆。边的默认样式为黑色实线箭头,我们可以在脚本中做一下修改,将顶点改为方形,边改为虚线。
定义顶点和边的样式
在digraph的花括号内,添加顶点和边的新定义:
node [shape="record"]; edge [style="dashed"];
则绘制的效果如下:
进一步修改顶点和边样式
进一步,我们将顶点a的颜色改为淡绿色,并将c到d的边改为红色,脚本如下:
digraph abc{ node [shape="record"]; edge [style="dashed"]; a [style="filled", color="black", fillcolor="chartreuse"]; b; c; d; a -> b; b -> d; c -> d [color="red"]; }
绘制的结果如下:
应当注意到,顶点和边都接受属性的定义,形式为在顶点和边的定义之后加上一个由方括号括起来的key-value列表,每个key-value对由逗号隔开。如果图中顶点和边采用统一的风格,则可以在图定义的首部定义node, edge的属性。比如上图中,定义所有的顶点为方框,所有的边为虚线,在具体的顶点和边之后定义的属性将覆盖此全局属性。如特定与a的绿色,c到d的边的红色。
子图的绘制
graphviz支持子图,即图中的部分节点和边相对对立(软件的模块划分经常如此)。比如,我们可以将顶点c和d归为一个子图:
digraph abc{ node [shape="record"]; edge [style="dashed"]; a [style="filled", color="black", fillcolor="chartreuse"]; b; subgraph cluster_cd{ label="c and d"; bgcolor="mintcream"; c; d; } a -> b; b -> d; c -> d [color="red"]; }
将c和d划分到cluster_cd这个子图中,标签为”c and d”,并添加背景色,以方便与主图区分开,绘制结果如下:
应该注意的是,子图的名称必须以cluster开头,否则graphviz无法设别。
数据结构的可视化
实际开发中,经常要用到的是对复杂数据结构的描述,graphviz提供完善的机制来绘制此类图形。
一个hash表的数据结构
比如一个hash表的内容,可能具有下列结构:
struct st_hash_type { int (*compare) (); int (*hash) (); }; struct st_table_entry { unsigned int hash; char *key; char *record; st_table_entry *next; }; struct st_table { struct st_hash_type *type; int num_bins; /* slot count */ int num_entries; /* total number of entries */ struct st_table_entry **bins; /* slot */ }
绘制hash表的数据结构
从代码上看,由于结构体存在引用关系,不够清晰,如果层次较多,则很难以记住各个结构之间的关系,我们可以通过下图来更清楚的展示:
脚本如下:
digraph st2{ fontname = "Verdana"; fontsize = 10; rankdir=TB; node [fontname = "Verdana", fontsize = 10, color="skyblue", shape="record"]; edge [fontname = "Verdana", fontsize = 10, color="crimson", style="solid"]; st_hash_type [label="{<head>st_hash_type|(*compare)|(*hash)}"]; st_table_entry [label="{<head>st_table_entry|hash|key|record|<next>next}"]; st_table [label="{st_table|<type>type|num_bins|num_entries|<bins>bins}"]; st_table:bins -> st_table_entry:head; st_table:type -> st_hash_type:head; st_table_entry:next -> st_table_entry:head [style="dashed", color="forestgreen"]; }
应该注意到,在顶点的形状为”record”的时候,label属性的语法比较奇怪,但是使用起来非常灵活。比如,用竖线”|”隔开的串会在绘制出来的节点中展现为一条分隔符。用”<>”括起来的串称为锚点,当一个节点具有多个锚点的时候,这个特性会非常有用,比如节点st_table的type属性指向st_hash_type,第4个属性指向st_table_entry等,都是通过锚点来实现的。
我们发现,使用默认的dot布局后,绿色的这条边覆盖了数据结构st_table_entry,并不美观,因此可以使用别的布局方式来重新布局,如使用circo算法:
则可以得到更加合理的布局结果。
hash表的实例
另外,这个hash表的一个实例如下:
脚本如下:
digraph st{ fontname = "Verdana"; fontsize = 10; rankdir = LR; rotate = 90; node [ shape="record", width=.1, height=.1]; node [fontname = "Verdana", fontsize = 10, color="skyblue", shape="record"]; edge [fontname = "Verdana", fontsize = 10, color="crimson", style="solid"]; node [shape="plaintext"]; st_table [label=< <table border="0" cellborder="1" cellspacing="0" align="left"> <tr> <td>st_table</td> </tr> <tr> <td>num_bins=5</td> </tr> <tr> <td>num_entries=3</td> </tr> <tr> <td port="bins">bins</td> </tr> </table> >]; node [shape="record"]; num_bins [label=" <b1> | <b2> | <b3> | <b4> | <b5> ", height=2]; node[ width=2 ]; entry_1 [label="{<e>st_table_entry|<next>next}"]; entry_2 [label="{<e>st_table_entry|<next>null}"]; entry_3 [label="{<e>st_table_entry|<next>null}"]; st_table:bins -> num_bins:b1; num_bins:b1 -> entry_1:e; entry_1:next -> entry_2:e; num_bins:b3 -> entry_3:e; }
上例中可以看到,节点的label属性支持类似于HTML语言中的TABLE形式的定义,通过行列的数目来定义节点的形状,从而使得节点的组成更加灵活。
软件模块组成图
Apache httpd模块关系
IDPV2后台的模块组成关系
在实际的开发中,随着系统功能的完善,软件整体的结构会越来越复杂,通常开发人员会将软件划分为可理解的多个子模块,各个子模块通过协作,完成各种各样的需求。
下面有个例子,是在IDPV2设计时的一个草稿:
IDP支持层为一个相对独立的子系统,其中包括如数据库管理器,配置信息管理器等模块,另外为了提供更大的灵活性,将很多其他的模块抽取出来作为外部模块,而支持层提供一个模块管理器,来负责加载/卸载这些外部的模块集合。
这些模块间的关系较为复杂,并且有部分模块关系密切,应归类为一个子系统中,上图对应的dot脚本为:
digraph idp_modules{ rankdir = TB; fontname = "Microsoft YaHei"; fontsize = 12; node [ fontname = "Microsoft YaHei", fontsize = 12, shape = "record" ]; edge [ fontname = "Microsoft YaHei", fontsize = 12 ]; subgraph cluster_sl{ label="IDP支持层"; bgcolor="mintcream"; node [shape="Mrecord", color="skyblue", style="filled"]; network_mgr [label="网络管理器"]; log_mgr [label="日志管理器"]; module_mgr [label="模块管理器"]; conf_mgr [label="配置管理器"]; db_mgr [label="数据库管理器"]; }; subgraph cluster_md{ label="可插拔模块集"; bgcolor="lightcyan"; node [color="chartreuse2", style="filled"]; mod_dev [label="开发支持模块"]; mod_dm [label="数据建模模块"]; mod_dp [label="部署发布模块"]; }; mod_dp -> mod_dev [label="依赖..."]; mod_dp -> mod_dm [label="依赖..."]; mod_dp -> module_mgr [label="安装...", color="yellowgreen", arrowhead="none"]; mod_dev -> mod_dm [label="依赖..."]; mod_dev -> module_mgr [label="安装...", color="yellowgreen", arrowhead="none"]; mod_dm -> module_mgr [label="安装...", color="yellowgreen", arrowhead="none"]; }
状态图
有限自动机示意图
上图是一个简易有限自动机,接受a及a结尾的任意长度的串。其脚本定义如下:
digraph automata_0 { size = "8.5, 11"; fontname = "Microsoft YaHei"; fontsize = 10; node [shape = circle, fontname = "Microsoft YaHei", fontsize = 10]; edge [fontname = "Microsoft YaHei", fontsize = 10]; 0 [ style = filled, color=lightgrey ]; 2 [ shape = doublecircle ]; 0 -> 2 [ label = "a " ]; 0 -> 1 [ label = "other " ]; 1 -> 2 [ label = "a " ]; 1 -> 1 [ label = "other " ]; 2 -> 2 [ label = "a " ]; 2 -> 1 [ label = "other " ]; "Machine: a" [ shape = plaintext ]; }
形状值为plaintext的表示不用绘制边框,仅展示纯文本内容,这个在绘图中,绘制指示性的文本时很有用,如上图中的”Machine: a”。
OSGi中模块的生命周期图
OSGi中,模块具有生命周期,从安装到卸载,可能的状态具有已安装,已就绪,正在启动,已启动,正在停止,已卸载等。如下图所示:
对应的脚本如下:
digraph module_lc{ rankdir=TB; fontname = "Microsoft YaHei"; fontsize = 12; node [fontname = "Microsoft YaHei", fontsize = 12, shape = "Mrecord", color="skyblue", style="filled"]; edge [fontname = "Microsoft YaHei", fontsize = 12, color="darkgreen" ]; installed [label="已安装状态"]; resolved [label="已就绪状态"]; uninstalled [label="已卸载状态"]; starting [label="正在启动"]; active [label="已激活(运行)状态"]; stopping [label="正在停止"]; start [label="", shape="circle", width=0.5, fixedsize=true, style="filled", color="black"]; start -> installed [label="安装"]; installed -> uninstalled [label="卸载"]; installed -> resolved [label="准备"]; installed -> installed [label="更新"]; resolved -> installed [label="更新"]; resolved -> uninstalled [label="卸载"]; resolved -> starting [label="启动"]; starting -> active [label=""]; active -> stopping [label="停止"]; stopping -> resolved [label=""]; }
其他实例
一棵简单的抽象语法树(AST)
表达式 (3+4)*5 在编译时期,会形成一棵语法树,一边在计算时,先计算3+4的值,最后与5相乘。
对应的脚本如下:
digraph ast{ fontname = "Microsoft YaHei"; fontsize = 10; node [shape = circle, fontname = "Microsoft YaHei", fontsize = 10]; edge [fontname = "Microsoft YaHei", fontsize = 10]; node [shape="plaintext"]; mul [label="mul(*)"]; add [label="add(+)"]; add -> 3 add -> 4; mul -> add; mul -> 5; }
简单的UML类图
下面是一简单的UML类图,Dog和Cat都是Animal的子类,Dog和Cat同属一个包,且有可能有联系(0..n)。
脚本:
digraph G{ fontname = "Courier New" fontsize = 10 node [ fontname = "Courier New", fontsize = 10, shape = "record" ]; edge [ fontname = "Courier New", fontsize = 10 ]; Animal [ label = "{Animal |+ name : String\l+ age : int\l|+ die() : void\l}" ]; subgraph clusterAnimalImpl{ bgcolor="yellow" Dog [ label = "{Dog||+ bark() : void\l}" ]; Cat [ label = "{Cat||+ meow() : void\l}" ]; }; edge [ arrowhead = "empty" ]; Dog->Animal; Cat->Animal; Dog->Cat [arrowhead="none", label="0..*"]; }
状态图
脚本:
digraph finite_state_machine { rankdir = LR; size = "8,5" node [shape = doublecircle]; LR_0 LR_3 LR_4 LR_8; node [shape = circle]; LR_0 -> LR_2 [ label = "SS(B)" ]; LR_0 -> LR_1 [ label = "SS(S)" ]; LR_1 -> LR_3 [ label = "S($end)" ]; LR_2 -> LR_6 [ label = "SS(b)" ]; LR_2 -> LR_5 [ label = "SS(a)" ]; LR_2 -> LR_4 [ label = "S(A)" ]; LR_5 -> LR_7 [ label = "S(b)" ]; LR_5 -> LR_5 [ label = "S(a)" ]; LR_6 -> LR_6 [ label = "S(b)" ]; LR_6 -> LR_5 [ label = "S(a)" ]; LR_7 -> LR_8 [ label = "S(b)" ]; LR_7 -> LR_5 [ label = "S(a)" ]; LR_8 -> LR_6 [ label = "S(b)" ]; LR_8 -> LR_5 [ label = "S(a)" ]; }
附录
事实上,从dot的语法及上述的示例中,很容易看出,dot脚本很容易被其他语言生成。比如,使用一些简单的数据库查询就可以生成数据库中的ER图的dot脚本。
如果你追求高效的开发速度,并希望快速的将自己的想法画出来,那么graphviz是一个很不错的选择。
当然,graphviz也有一定的局限,比如绘制时序图(序列图)就很难实现。graphviz的节点出现在画布上的位置事实上是不确定的,依赖于所使用的布局算法,而不是在脚本中出现的位置,这可能使刚开始接触graphviz的开发人员有点不适应。graphviz的强项在于自动布局,当图中的顶点和边的数目变得很多的时候,才能很好的体会这一特性的好处:
比如上图,或者较上图更复杂的图,如果采用手工绘制显然是不可能的,只能通过graphviz提供的自动布局引擎来完成。如果仅用于展示模块间的关系,子模块与子模块间通信的方式,模块的逻辑位置等,graphviz完全可以胜任,但是如果图中对象的物理位置必须是准确的,如节点A必须位于左上角,节点B必须与A相邻等特性,使用graphviz则很难做到。毕竟,它的强项是自动布局,事实上,所有的节点对与布局引擎而言,权重在初始时都是相同的,只是在渲染之后,节点的大小,形状等特性才会影响权重。
本文只是初步介绍了graphviz的简单应用,如图的定义,顶点/边的属性定义,如果运行等,事实上还有很多的属性,如画布的大小,字体的选择,颜色列表等,大家可以通过graphviz的官网来找到更详细的资料。