11 2020 档案
svtools prune具体算法
摘要：svtools具有不同的子命令以实现不同的功能，其中一个就是lmerge。根据其help信息(cluster and prune a BEDPE file by position based on allele frequency)可以看出，它是对BEDPE文件内的变异进行聚类和修剪的。 zcat
svtools lmerge具体算法
摘要：svtools具有不同的子命令以实现不同的功能，其中一个就是lmerge。根据其帮助文档(merge LUMPY calls inside a single file from svtools lsort)可以看出，它是在lsort之后对一个vcf文件内的变异进行合并的，但只是知道它的功能而不知道它
torque提交作业
摘要：PBS（Protable Batch System）是功能最为齐全，历史最悠久，支持最广泛的本地集群调度器之一。 PBS的目前包括openPBS，PBS Pro和Torque三个主要分支。其中OpenPBS是最早的PBS系统，目前已经没有太多后续开发，PBS pro是PBS的商业版本，功能最为丰富。
ls小技巧
摘要：一、ls -rt ls的功能是列出指定路径下的所有文件，但是有时候文件太多，不方便查找哪些是新生成的文件时，可以使用ls -t或ls -rt命令。 ls -t ls -rt 那是什么意思呢？这里-t就是按照时间顺序排列的意思，这个时候最后生成的文件就会出现在列表的上边，原来的文件在下边，即按照生成时
echo输出
摘要：linux中不免经常使用echo进行输出，或输出到屏幕，或输出到文件。但是使用的时候会发现，在想要输出一些需要转义的字符时，例如\t等，它却原样不动的输出了。 使用man命令查看echo的帮助文档，会发现有一个-e参数，和对应的-E参数，它俩决定是按照转义进行输出还是按照原样进行输出。在echo输出
linux输出文件名及全路径
摘要：有时候需要输出一个文件夹下的文件名及所以绝对路径，在网上找到是这个命令 ls | sed "s:^:`pwd`/:" 看命令不难理解，先是ls列出所有文件名，再使用管道符进行后续操作。在管道符之后，是使用sed进行一个替换，^是指字符串开头的意思，`pwd`是指执行pwd的结果，即当前目录的绝对路径
svtools简介
摘要：svtools - Comprehensive utilities to explore structural variations in genomes svtools不仅是一个工具，更因为它带有许多子命令而形成一套工具，旨在帮助生物信息工作者构建和探索群体水平的结构变异召回信息。它能够在成千上万
