10 2020 档案
单细胞测序学习（二）
摘要：三、单细胞测序原理 今天主要介绍单细胞测序原理。10X Genomics和BD Rhapsody是目前单细胞测序的两大主流平台，所以今天的单细胞测序原理介绍也是基于这两个平台的。 （1）10X Genomics单细胞测序原理 上图是10X单细胞测序的原理图。首先要说明的是，单细胞测序和Bulk RN
单细胞测序学习（一）
摘要：一、单细胞测序简介 单细胞测序技术（single cell sequencing）是指在单个细胞水平上，对基因组、转录组、表观组进行高通量测序分析的一项新技术，它能够弥补传统高通量测序的局限性，揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态，反映细胞间的异质性。 我们经常看到的scRNA-seq其实就是sin
Apgar score
摘要：Apgar score Apgar is a quick test performed on a baby at 1 and 5 minutes after birth. The 1-minute score determines how well the baby tolerated the bi
linux下安装Perl
摘要：下载Perl安装包 在CPAN（Perl语言安装模块的网址）搜索Perl，获得Perl的下载地址，以perl5为例 #在linux下使用wget直接下载Perl安装包 wget https://www.cpan.org/src/5.0/perl-5.28.0.tar.gz #解压安装包 tar -x
linux下使用CPAN安装Perl模块
摘要：首先从CPAN网站下载CPAN模块 此处使用wget命令直接在linux下下载： wget https://cpan.metacpan.org/authors/id/A/AN/ANDK/CPAN-2.26.tar.gz 下载后解压 tar -zxvf CPAN-2.26.tar.gz 进入解压后文件
snpEff安装
摘要：下载安装包： wget http://sourceforge.net/projects/snpeff/files/snpEff_v3_6_core.zip 解压安装包： unzip snpEff_v3_6_core.zip 切换到解压后文件夹： cd snpEff_v3_6_core 使用java包
linux下VEP的安装
摘要：VEP（Variant Effect Predictor）作为Ensembl官方推出的变异影响预测软件，被广泛使用，以下内容也来自Ensembl 软件包下载（ZIP格式）： curl -L-Ohttps://github.com/Ensembl/ensembl-vep/archive/release
linux下查看文件行数和列数
摘要：查看行数： wc -l 文件名 查看列数： cat 文件名 | awk '{print NF}' 注意：默认是\t分割 但是可以使用-F参数指定分隔符，例如以 | 进行分割： cat 文件名 | awk -F "|" '{print NF}'
R语言画图常用参数
摘要：plot(x,xlab = "degree",ylab = "number of nodes",main = "mRNA degree distribute",lwd = 5,col = "darkred",xlim = c(1,21),bty = "n",ylim = c(0,200),lend
