linux下VEP的安装
VEP(Variant Effect Predictor)作为Ensembl官方推出的变异影响预测软件,被广泛使用,以下内容也来自Ensembl
软件包下载(ZIP格式):
curl -L-Ohttps://github.com/Ensembl/ensembl-vep/archive/release/96.zip
下载版本为96版本
解压文件并进入解压后文件夹:
unzip 96.zip
cd ensembl-vep-release-96/
运行以下命令进行安装:
perl INSTALL.pl