随笔分类 - R
R语言系列—Rstudio简介和安装
摘要:同学们,大家好,今天继续更新R语言系列。今天我们开始讲R语言的集成开发环境(IDE)—Rstudio,这里会对Rstudio及其安装进行介绍,感兴趣的同学可以重点关注一下。 Rstudio简介 Rstudio是R语言一个常用的集成开发环境(IDE),包括控制台、语法高亮显示的编辑器,支持直接代码执行
使用R语言查询某物种所有通路及通路内的基因
摘要:使用R语言查询某物种所有通路及通路内的基因,这里使用Y书的clusterProfiler包。 这里以人类为例查询所有通路及通路内的基因: library(R.utils) R.utils::setOption("clusterProfiler.download.method","auto") hsa
R语言画图常用参数
摘要:plot(x,xlab = "degree",ylab = "number of nodes",main = "mRNA degree distribute",lwd = 5,col = "darkred",xlim = c(1,21),bty = "n",ylim = c(0,200),lend
一个R包—reticulate—在R中调用Python
摘要:R语言和python语言是生信行业经常使用的两个计算机语言,R语言具有统计和画图方面的优势,但是R语言在文件读写上的速度实在不敢恭维;Python具有较快的文件读写功能,但是其统计和画图却不如R语言用着方便。 今天介绍一个R包——“reticulate”,可以在R语言中直接调用Python,这样就可