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小小的米粒

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03 2022 档案

关于单细胞的那些存储类型
摘要:他的出现一定有他的理由,他的离开也有他的理由 随着单细胞测序数据的增长,如果把数据全部导入内存则占用的内存太大,如何处理这个问题呢,一种思路是不一次直接将数据导入内存,一种是优化内存存储。针对这两种思路们都有相应的包。现在的格式太多了,h5ad,loom,h5seurat,这些格式有什么区别呢? 1 阅读全文

posted @ 2022-03-20 16:44 小小的米粒 阅读(788) 评论(0) 推荐(0)

PAM50怎么计算
摘要:看来还得和临床结合才知道为什么提出问题 问题的背景 为什么提出PAM50分型,因为乳腺癌病人的异质性特别大,所以需要将这些病人进行一个分型,以便更好的治疗。 发展的历史 最初是根据免疫组化的三个指标进行分型的 HR+ HER2- HR+ HER2+ HR- HER2+ TNBC 随着RNA-seq的 阅读全文

posted @ 2022-03-18 14:37 小小的米粒 阅读(1169) 评论(0) 推荐(0)

 
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