摘要:气泡图 可以利用圆圈的大小和颜色呈现不同的信息。 颜色=大小 上图可以很明显的比较不同癌症中,重点基因的表达上调,下调情况。 输入数据: CancerType SEMA3A SEMA3B SEMA3C SEMA3D SEMA3E SEMA3F SEMA3G ACC 0.3058794 0.67491
阅读全文
12 2023 档案
摘要:小提琴图代码 1. 单个基因表达_临床特征分组 输入数据: id Stage SEMA3A TCGA-F1-6177-01A Stage I 0.2202665 TCGA-IN-A6RI-01A Stage I 0.1181326 TCGA-VQ-A8PX-01A Stage I 0.3914619
阅读全文
摘要:1. GO富集分析 输入数据 使用 enrichGO {clusterProfiler} 函数得到 ONTOLOGY ID Term GeneRatio BgRatio pvalue p.adjust qvalue geneID Count BP GO:0032496 response to lip
阅读全文
摘要:免疫细胞浸润百分比堆积条形图 该条形图展示的是每个TCGA的肿瘤样本中各个免疫细胞所占的比例。 输入数据 该输入数据的每一行显示的是一个TCGA的肿瘤样本中各个免疫细胞所占的比例。每一行的数据用制表符“\t”分隔。 Mixture B cells naive B cells memory Plasm
阅读全文
摘要:相邻节点数量条形图 结果图展示 该条形图展示的是相邻节点数(number of adjacent nodes)最高的前几位节点。 输入数据 该输入数据的每一行都显示的是两个存在连接的相邻节点(adjacent nodes)。 node1 node2 RAD51 MND1 ZWINT BUB1B IL
阅读全文