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11 2023 档案

摘要:表达矩阵文件一般比较大,小的几百M,大的1-2个G,浏览器直接下载很慢,后台一直打包下载不下来。 1.用命令行下载。 gdc-client工具下载网站: https://gdc.cancer.gov/access-data/gdc-data-transfer-tool 。此外,用 gdc-clien 阅读全文
posted @ 2023-11-06 13:49 小高不高 阅读(265) 评论(0) 推荐(0) 编辑

摘要:1. Perl 官网下载 https://www.perl.org/ : 点击DOWNLOAD进入下载: 推荐使用Strawberry Perl,该版本与其它系统的兼容性比较好,自带的包也比较多。点击“Strawberry Perl”进入下载: 选择 “strawberry-perl-5.38.0. 阅读全文
posted @ 2023-11-05 15:54 小高不高 阅读(219) 评论(0) 推荐(1) 编辑

摘要:下载和整理数据包括了表达数据和临床数据。 下载和整理好了数据之后,提取目标基因的表达量。 ① 差异分析:可以观察这个基因在正常样品和肿瘤样品之间是否具有差异。 ② 生存分析:通过生存分析,可以观察目标基因的表达量与病人的预后之间是否具有相关性。 ③ 临床相关性分析:通过临床相关性分析,可以观察目标基 阅读全文
posted @ 2023-11-02 14:33 小高不高 阅读(406) 评论(0) 推荐(1) 编辑

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