摘要：
1. 什么是GSEA？ Gene Set Enrichment Analysis (GSEA，基因集富集分析)用来评估一个预先定义的基因集的基因在与表型相关度排序的基因表中的分布趋势，从而判断其对表型的贡献。 2. 有GO/KEGG富集分析了，为什么还要做GSEA？ GO/KEGG富集分析是先筛选差 阅读全文
摘要：
1. KEGG富集分析简介 1. KEGG富集分析的作用 在生物信息学分析过程中，KEGG通路富集分析常常应用于差异表达基因的功能注释，了解差异表达基因的相关功能与作用通路。 2. KEGG气泡图的解读 例如上图显示的是KEGG点状图，横轴GeneRatio表示对应pathway差异基因数/能够对应 阅读全文
摘要：
1. 散点图和箱线图的差别： 箱线图就是散点图把横坐标弱化的结果。弱化个体的概念，强化群体的概念，把同一个分组放到一起，就形成了箱线图。 箱线图的输入数据是一个数值型向量和一个字符串向量（重复值） 2. 箱线图： 3. 箱线图的作用： 单个基因在两组之间的表达量差异。如果是多个基因，则需要量化指标： 阅读全文
摘要：
数据降维 在进行数据挖掘或者机器学习时，我们面临的数据往往是高维数据。相较于低维数据，高维数据为我们提供了更多的信息和细节，也更好的描述了样本；但同时，很多高效且准确的分析方法也将无法使用。处理高维数据和高维数据可视化是数据科学家们必不可少的技能。解决这个问题的方法便是降低数据的维度。在数据降维时， 阅读全文