2022 年 9月 16 日随笔档案 - 小高不高

2022年9月16日

摘要： 1. 配对样本的差异分析在差异分析的数据处理中，只有design这一行代码有区别 pairinfo = factor(c(1,2,1,3,2,3)) design = model.matrix(~group_list + pairinfo) 配对信息：1，2，3分别为三个病人；分组信息：由gro 阅读全文

posted @ 2022-09-16 00:11 小高不高阅读(318) 评论(0) 推荐(0) 编辑

GEO代码分析流程 - 6. 富集分析 - GO、KEGG、GSEA

摘要： 0. 准备 setwd("D:/R/CHOL") rm(list = ls()) load(file = "step4output.Rdata") library(clusterProfiler) library(dplyr) library(ggplot2) 构建kegg_plot函数（以up_k 阅读全文

posted @ 2022-09-16 00:09 小高不高阅读(1274) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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