06 2017 档案

JAVA 中转义符的理解

摘要：生物信息中有时候会遇到JAVA写的程序，今天阅读源码的时候发现对于正则中的转义符不好理解，后来查资料后终于弄明白了，这里详细说明一下：字符串的表示有三种方法：1、直接单字符，例如“A”；2、由转义字符表示的特殊字符，例如“\t”; 3、Unicode字符，例如“\u0008”。其中转义字符表示的字阅读全文

posted @ 2017-06-29 00:35 生信老码农阅读(3834) 评论(0) 推荐(1) 编辑

在线引物设计网站，老板推荐的，亲测好用

摘要：直接上连接： http://primer3plus.com/cgi-bin/dev/primer3plus.cgi 阅读全文

posted @ 2017-06-17 23:55 生信老码农阅读(5966) 评论(0) 推荐(0) 编辑

列出一个买东西的好网站，值得推荐

摘要：十大品牌网，链接在这里，以后买各种东西都可以来这里查询一下！ http://www.china-10.com/ 阅读全文

posted @ 2017-06-17 22:20 生信老码农阅读(239) 评论(0) 推荐(0) 编辑

R语言集合操作

摘要：熟练运用R语言的集合操作在很多时候可以省去for循环，从而提升数据处理效率。废话不多说，集合操作相对简单，贴一段代码就懂了！阅读全文

posted @ 2017-06-11 20:40 生信老码农阅读(1147) 评论(0) 推荐(0) 编辑

R语言do.call 函数用法详解

摘要：虽然R语言有类型很丰富的数据结构，但是很多时候数据结构比较复杂，那么基本就会用到list这种结构的数据类型。但是list对象很难以文本的形式导出，因此需要一个函数能快速将复杂的list结构扁平化成dataframe。这里要介绍的就是do.call函数。这里是do.call 函数的官方文档： Exe 阅读全文

posted @ 2017-06-11 10:58 生信老码农阅读(21581) 评论(0) 推荐(3) 编辑

关于bedtools merge 功能中sort 命令的解释

摘要：Bedtools 是一个很好的用来处理区间的工具，很多时候用这个底层语言编写的小工具比自己写的脚本运行快很多，但是这个工具中的某些功能对输入文件有一定的要求，比如说里面的一个merge函数，这是里面的一个note： Note： bedtools merge requires that you pre 阅读全文

posted @ 2017-06-08 15:06 生信老码农阅读(2554) 评论(0) 推荐(0) 编辑

关于基因组注释文件GTF的解释

摘要：GTF文件的全称是gene transfer format，主要是对染色体上的基因进行标注。怎么理解呢，其实所谓的基因名，基因座等，都只是后来人们给一段DNA序列起的名字而已，还原到细胞中就是细胞核里面的一条长长的染色体（DNA序列）。而这个GTF文件的主要功能，就是指出我们所谓的基因在染色体上的位阅读全文

posted @ 2017-06-06 10:44 生信老码农阅读(14010) 评论(0) 推荐(1) 编辑