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摘要： 介绍网址： http://www.linuxfromscratch.org/blfs/view/cvs/general/boost.html Introduction to Boost Boost提供了很多基于C++写的库，它包含了 linear algebra, pseudorandom numb 阅读全文

摘要： 案例描述： 需要将Sample_test1_R1.fastq.gz和Sample_test2_R2.fastq.gz合并为test.fastq.gz 操作方法1： 先zcat再gzip 1 操作方法2： 直接cat 1 结果对比 压缩文件大小 ll test*.gz -rw-r–r– 1 An La 阅读全文

摘要： # 估算测序深度、reads数目、N50等值（自写perl程序）： $ perl ~/TangerScript/fqStat -i sunset.raw.subreads.fastq -g 372m 统计结果如下： # 基因组组装三步走1. Correction 2. Assembly 3. Pol 阅读全文

摘要： 一、使用conda安装virtualenv $ conda install virtualenv 二、创建一个名为 VE-QUIVER的虚拟环境 $ cd; virtualenv -p python2.7 --no-site-packages VE-QUIVER ## 这是一个组合命令，代表先回到h 阅读全文

摘要： 介绍网址： http://www.linuxfromscratch.org/blfs/view/cvs/general/boost.html Introduction to Boost Boost提供了很多基于C++写的库，它包含了 linear algebra, pseudorandom numb 阅读全文

摘要： then switch to the seqtk directory and make it: Now you can invoke it as such: Convert FASTQ to FASTA: seqtk seq -a in.fq.gz > out.fa Convert ILLUMINA 阅读全文

摘要： # 用于fasta格式文件的碱基数目和GC含量的统计 grep -v '>' input.fa| perl -ne '{$count_A=$count_A+($_=~tr/A//);$count_T=$count_T+($_=~tr/T//);$count_G=$count_G+($_=~tr/G/ 阅读全文

摘要： Conda简介（本文由www.169it.com搜集整理）Anaconda是一个Python下和Canopy类似的的科学计算环境，但用起来更加方便。自带的包管理器conda也很强大。Python科学计算环境conda的下载Conda官方主页: https://github.com/conda/con 阅读全文

摘要： 一、打开python主页:https://www.python.org/downloads/ 本次安装选择Pthon 2.7.13版本 二、下载python安装包：https://www.python.org/downloads/release/python-2713/ 三、安装 $ tar xf 阅读全文

摘要： 一、Linux服务器安装canu 1. 下载canu（版本canu-1.4） 首先打开Canu安装包下载网页：https://github.com/marbl/canu/releases 下载Source code并上传到服务器上： 2. 解压文件、编译 按照一下安装步骤安装即可： 3. 设置环境变 阅读全文