最长公共子序列问题(转)
2011-08-21 22:24 Daniel Zheng 阅读(331) 评论(0) 编辑 收藏 举报转自http://blog.csdn.net/yysdsyl/article/details/4226630
动态规划法
经常会遇到复杂问题不能简单地分解成几个子问题,而会分解出一系列的子问题。简单地采用把大问题分解成子问题,并综合子问题的解导出大问题的解的方法,问题求解耗时会按问题规模呈幂级数增加。
为了节约重复求相同子问题的时间,引入一个数组,不管它们是否对最终解有用,把所有子问题的解存于该数组中,这就是动态规划法所采用的基本方法。
【问题】 求两字符序列的最长公共字符子序列
问题描述:字符序列的子序列是指从给定字符序列中随意地(不一定连续)去掉若干个字符(可能一个也不去掉)后所形成的字符序列。令给定的字符序列X=“x0,x1,…,xm-1”,序列Y=“y0,y1,…,yk-1”是X的子序列,存在X的一个严格递增下标序列<i0,i1,…,ik-1>,使得对所有的j=0,1,…,k-1,有xij=yj。例如,X=“ABCBDAB”,Y=“BCDB”是X的一个子序列。
考虑最长公共子序列问题如何分解成子问题,设A=“a0,a1,…,am-1”,B=“b0,b1,…,bm-1”,并Z=“z0,z1,…,zk-1”为它们的最长公共子序列。不难证明有以下性质:
(1) 如果am-1=bn-1,则zk-1=am-1=bn-1,且“z0,z1,…,zk-2”是“a0,a1,…,am-2”和“b0,b1,…,bn-2”的一个最长公共子序列;
(2) 如果am-1!=bn-1,则若zk-1!=am-1,蕴涵“z0,z1,…,zk-1”是“a0,a1,…,am-2”和“b0,b1,…,bn-1”的一个最长公共子序列;
(3) 如果am-1!=bn-1,则若zk-1!=bn-1,蕴涵“z0,z1,…,zk-1”是“a0,a1,…,am-1”和“b0,b1,…,bn-2”的一个最长公共子序列。
这样,在找A和B的公共子序列时,如有am-1=bn-1,则进一步解决一个子问题,找“a0,a1,…,am-2”和“b0,b1,…,bm-2”的一个最长公共子序列;如果am-1!=bn-1,则要解决两个子问题,找出“a0,a1,…,am-2”和“b0,b1,…,bn-1”的一个最长公共子序列和找出“a0,a1,…,am-1”和“b0,b1,…,bn-2”的一个最长公共子序列,再取两者中较长者作为A和B的最长公共子序列。
求解:
引进一个二维数组c[][],用c[i][j]记录X[i]与Y[j] 的LCS 的长度,b[i][j]记录c[i][j]是通过哪一个子问题的值求得的,以决定搜索的方向。
我们是自底向上进行递推计算,那么在计算c[i,j]之前,c[i-1][j-1],c[i-1][j]与c[i][j-1]均已计算出来。此时我们根据X[i] = Y[j]还是X[i] != Y[j],就可以计算出c[i][j]。
问题的递归式写成:
回溯输出最长公共子序列过程:
算法分析:
由于每次调用至少向上或向左(或向上向左同时)移动一步,故最多调用(m + n)次就会遇到i = 0或j = 0的情况,此时开始返回。返回时与递归调用时方向相反,步数相同,故算法时间复杂度为Θ(m + n)。
1 #include <stdio.h>
2 #include <string.h>
3 #define MAXLEN 100
4
5 void LCSLength(char *x, char *y, int m, int n, int c[][MAXLEN], int b[][MAXLEN])
6 {
7 int i, j;
8
9 for(i = 0; i <= m; i++)
10 c[i][0] = 0;
11 for(j = 1; j <= n; j++)
12 c[0][j] = 0;
13 for(i = 1; i<= m; i++)
14 {
15 for(j = 1; j <= n; j++)
16 {
17 if(x[i-1] == y[j-1])
18 {
19 c[i][j] = c[i-1][j-1] + 1;
20 b[i][j] = 0;
21 }
22 else if(c[i-1][j] >= c[i][j-1])
23 {
24 c[i][j] = c[i-1][j];
25 b[i][j] = 1;
26 }
27 else
28 {
29 c[i][j] = c[i][j-1];
30 b[i][j] = -1;
31 }
32 }
33 }
34 }
35
36 void PrintLCS(int b[][MAXLEN], char *x, int i, int j)
37 {
38 if(i == 0 || j == 0)
39 return;
40 if(b[i][j] == 0)
41 {
42 PrintLCS(b, x, i-1, j-1);
43 printf("%c ", x[i-1]);
44 }
45 else if(b[i][j] == 1)
46 PrintLCS(b, x, i-1, j);
47 else
48 PrintLCS(b, x, i, j-1);
49 }
50
51 int main(int argc, char **argv)
52 {
53 char x[MAXLEN] = {"ABCBDAB"};
54 char y[MAXLEN] = {"BDCABA"};
55 int b[MAXLEN][MAXLEN];
56 int c[MAXLEN][MAXLEN];
57 int m, n;
58
59 m = strlen(x);
60 n = strlen(y);
61
62 LCSLength(x, y, m, n, c, b);
63 PrintLCS(b, x, m, n);
64
65 return 0;
66 }