摘要: 4.NGS中的reads mapping 顾名思义,就是将测序的得到的DNA定位在基因组上。 因为二代测序的得到的序列是较短的,reads mapping很好地解决了这个问题。 本质上reads mapping是一个双序列比对问题,但和之前讲的NW和SW的不一样,后者适用于两者长度相差不大的。 现在 阅读全文
posted @ 2018-10-20 11:13 lypbendlf 阅读(2992) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 数据分析流程 来自知乎孟浩巍的“快速入门生物信息学的”Live 1.数据质控 首先是质控部分,使用fastqc进行对结果分析。 对于Illumia二代测序的结果质控包括两个方面,去掉测序质量不好的序列,即Quality Control;二是需要去掉连在玻璃上的短的接头,cut adaptor。 -t 阅读全文
posted @ 2018-10-20 11:12 lypbendlf 阅读(1468) 评论(0) 推荐(0) 编辑