论文解读(GIN)《How Powerful are Graph Neural Networks》

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论文标题:How Powerful are Graph Neural Networks
论文作者:Keyulu Xu, Weihua Hu, J. Leskovec, S. Jegelka
论文来源:2019, ICLR
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1 Introduction

  GNN 目前主流的做法是递归迭代聚合一阶邻域表征来更新节点表征,如 GCN 和 GraphSAGE,但这些方法大多是经验主义,缺乏理论去理解 GNN 到底做了什么,还有什么改进空间。

  GNN 的变体均是遵循两个步骤:邻居聚合(neighborhood aggregation) 和 图池化(graph-level pooling)。  

  本文框架受 GNNs 和 WL 图同质测试的启发,若 GNNs 对不同构图能很好识别,则认为是具有较强的表征能力。

  本文贡献:

    • 证明了GNN最多只和 Weisfeiler-Lehman (WL) test 一样有效,即 WL test 是GNN性能的上限;
    • 建立了邻域聚合(neighbor aggregation)和图读出函数(graph readout functions)的条件,在这些条件下,得到的 GNN 与 WL test 一样强大;
    • 提出图同构网络(Graph Isomorphism Network——GIN),并证明了它的判别、表征能力等于 WL test 的能力;

2 Preliminaries

2.1 GNN steps

  GNN 常见的两步走:1、聚合邻居信息;2、更新节点学习

  GNN 的 第 $k$ 层 表达式:

    $a_{v}^{(k)}=\text { AGGREGATE }^{(k)}\left(\left\{h_{u}^{(k-1)}: u \in \mathcal{N}(v)\right\}\right)$

    $h_{v}^{(k)}=\operatorname{COMBINE}^{(k)}\left(h_{v}^{(k-1)}, a_{v}^{(k)}\right)$

  AGGREGATE 比较典型的例子是 GraphSAGE:

  GraphSAGE 的 AGGREGATE 被定义为:

    $a_{v}^{(k)}=\operatorname{MAX}\left(\left\{\operatorname{ReLU}\left(W \cdot h_{u}^{(k-1)}\right), \forall u \in \mathcal{N}(v)\right\}\right)$

   这里的 $MAX $ 代表的是 element-wise max-pooling 。

   GraphSAGE 的 COMBINE 为 :

    $W \cdot\left[h_{v}^{(k-1)}, a_{v}^{(k)}\right]$

   而在 GCN 中,AGGREGATE 和 COMBINE 集成为:

    $h_{v}^{(k)}=\operatorname{ReLU}\left(W \cdot \operatorname{MEAN}\left\{h_{u}^{(k-1)}, \forall u \in \mathcal{N}(v) \cup\{v\}\right\}\right)$

  对于节点分类任务,节点表示 $h_{v}^{(K)}$ 将作为预测的输入;对于图分类任务,READOUT 函数聚合了最后一次迭代输出的节点表示$h_{v}^{(K)}$ ,并生成图表示 $h_{G}$ :

    $ h_{G}=\operatorname{READOUT}\left(\left\{h_{v}^{(K)} \mid v \in G\right\}\right)$

  其中:READOUT 函数是具有排列不变性的函数,如:summation。

2.2 Weisfeiler-Lehman test

  图同构问题( graph isomorphism problem):询问这两个图在拓扑结构上是否相同。

  WL test  为了辨别多标签图,具体步骤如下:[ 参考《Weisfeiler-Lehman(WL) 算法和WL Test》 ]

    • 迭代地聚合节点及其邻域的标签;
    • 将聚合后的标签散列为唯一的新标签。如果在某次迭代中,两个图之间的节点标签不同,则该算法判定两个图是非同构的;

  基于 WL test 的多图相似性判别算法 WL subtree kernel 也被提出,图示如下:

    

  上述过程是将 2WL test 保存为树结构。

3 Theoretical framework:overview

  Definition 1 (Multiset). A multiset is a generalized concept of a set that allows multiple instances for its elements. More formally, a multiset is a 2-tuple  $X=(S, m)$  where  $S$  is the underlying set of  $X$  that is formed from its distinct elements, and  $m: S \rightarrow \mathbb{N}_{\geq 1}$  gives the multiplicity of the elements.

  假设节点 $v$ 及其邻居集合 $\mathcal{N} (v)$ ,假设节点 $v$ 的标签是 1 ,其 $\mathcal{N} (v)$ 对应的标签是 1、1、2、3、4,可以把邻居集合看成一个 Multiset 。

4 Building powerful graph neural networks

  作者提出 Theorem 2:即为图同质测试。

  Lemma 2. Let  $G_{1}$  and  $G_{2}$  be any two non-isomorphic graphs. If a graph neural network  $\mathcal{A}: \mathcal{G} \rightarrow \mathbb{R}^{d}$  maps  $G_{1}$  and  $G_{2}$  to different embeddings, the Weisfeiler-Lehman graph isomorphism test also decides  $G_{1}$  and  $G_{2}$  are not isomorphic.

  Lemma 2 证明:

  假设:如果节点标签一致,那么节点表示也一致。

  假设对节点 $v$ 做了 $k$ 次 WL test 标签聚合,其最终标签若相似,则节点表示也一致。那么如果在 GNN 中,$k$ hop 邻域一样,那么必然节点表示一样。WL test 过程和 GNN 聚合过程是一致的。 

  作者提出 Theorem 3:如果 GNN 中 Aggregate、Combine 和 Readout 函数是单射,GNN 可以和 WL test 一样强大。

  Theorem 3. Let  $\mathcal{A}: \mathcal{G} \rightarrow \mathbb{R}^{d}$  be a  GNN . With a sufficient number of GNN layers,  $\mathcal{A}$  maps any graphs  $G_{1}$  and  $G_{2}$  that the Weisfeiler-Lehman test of isomorphism decides as non-isomorphic, to different embeddings if the following conditions hold:

   a) A aggregates and updates node features iteratively with

    $h_{v}^{(k)}=\phi\left(h_{v}^{(k-1)}, f\left(\left\{h_{u}^{(k-1)}: u \in \mathcal{N}(v)\right\}\right)\right)$

       where the functions $f$,  which operates on multisets, and $\phi$ are injective(单射). 

   b)  $\mathcal{A}$'s graph-level readout, which operates on the multiset of node features $\left\{h_{v}^{(k)}\right\}$ , is injective. 

  Theorem 3 证明和 Lemma2 证明思想类似,都是基于相同假设。

4.1 Graph isomorphism network(GIN)

  为建模邻居聚合的单射多集函数。

  下述 Lemma 5 阐述 sum aggregators 是单射的

  Lemma 5. Assume $\mathcal{X}$ is countable. There exists a function $f: \mathcal{X} \rightarrow \mathbb{R}^{n}$ so that $h(X)=\sum_{x \in X} f(x)$ is unique for each multiset $X \subset \mathcal{X}$ of bounded size. Moreover, any multiset function $g$ can be decomposed as $g(X)=\phi\left(\sum\limits _{x \in X} f(x)\right)$ for some function $\phi $.

  Lemma5 证明:

  出发点:考虑一个有 $N$ 个 元素的 multiset ,对其进行任意划分,最多可以划分成 $N$ 个子集,所以很自然的可以使用 $N$ 个正整数对其打上唯一标记,因此证明 $f$ 可以是唯一的单射函数。

  

  Corollary 6. Assume  $\mathcal{X}$  is countable. There exists a function  $f: \mathcal{X} \rightarrow \mathbb{R}^{n}$  so that for infinitely many choices of  $\epsilon$ , including all irrational numbers,  $h(c, X)=(1+\epsilon) \cdot f(c)+\sum\limits _{x \in X} f(x)$  is unique for each pair  $(c, X)$ , where  $c \in \mathcal{X}$  and  $X \subset \mathcal{X}$  is a multiset of bounded size. Moreover, any function $g$ over such pairs can be decomposed as $ g(c, X)=\varphi\left((1+\epsilon) \cdot f(c)+\sum\limits_{x \in X} f(x)\right)$  for some function  $\varphi $.

  Corollary 6 证明:

  

  对于第一种情况利用 Lemma 5 解释,对于第二种情况利用无理数 $\epsilon$ 的性质。

  Corollary 6 证明了 $ h(c, X)=(1+\epsilon) \cdot f(c)+\sum\limits_{x \in X} f(x)$ 是单射函数,同时本文也将 $\varphi$ 和 $f$ 用 MLP 代替(由于 MLP 是万能近似函数,可以模拟单射性质),又根据单射的性质  (若 $f$ 和 $g$ 皆为单射的,则 $f o g$ 亦为单射),得 $MLP(h(c, X))$ 也是单射的,即:

    $h_{v}^{(k)}=\operatorname{MLP}^{(k)}\left(\left(1+\epsilon^{(k)}\right) \cdot h_{v}^{(k-1)}+\sum\limits _{u \in \mathcal{N}(v)} h_{u}^{(k-1)}\right)  \quad\quad\quad({\large \star } )$

4.2 Graph-level readout of GIN 

  Readout 模块使用 concat+sum,对每次迭代得到的所有节点特征求和得到图的特征,然后拼接起来。

    $h_{G}=\operatorname{CONCAT}\left(\operatorname{READOUT}\left(\left\{h_{v}^{(k)} \mid v \in G\right\}\right) \mid k=0,1, \ldots, K\right)$

  即

    $h_{G}=\operatorname{CONCAT}\left(\operatorname{sum}\left(\left\{h_{v}^{(k)} \mid v \in G\right\}\right) \mid k=0,1, \ldots, K\right)$

5 Less powerful but still interesting GNNs

   本文研究不满足 Theorem 3 的 GraphSAGE 和 GCN,做了两个消融实验:

    • 1-layer perceptrons instead of MLPs .  
    • mean or max-pooling instead of the sum.  

5.1 1-layer perceotrons are not sufficient

  许多GNN 任然采用 1 层的 perceptrons,对于某些 multiset 可能存在无法区别的问题。

  Lemma 7. There exist finite multisets  $X_{1} \neq X_{2}$  so that for any linear mapping  $W $,  ${\small \sum\limits_{x \in X_{1}} \operatorname{ReLU}(W x)=\sum\limits_{x \in X_{2}} \operatorname{ReLU}(W x)} $.

  Lemma 7 证明:

  

  1 层的 perceptrons 表现得很像线性映射,因此 GNN 层退化为对邻域特征的简单求和。本文的证明建立在线性映射中缺乏偏差项这一事实之上。有了偏差项和足够大的输出维数,1 层的 perceptrons 可能能够区分不同的 multiset。

5.2 Structures that confuse mean and max-pooling

  现在考虑将 $h(X)=\sum\limits _{x \in X} f(x)$ 中的 sum 替换为 Mean-pooling 和 Max-pooling 将产生什么问题。

  Mean-pooling 和 max-pooling aggregators 在某种程度上是一种好的 multiset functions [ 具有平移不变性 ],但是他们不是单射的。

  Figure 2 根据三个 aggregators 的表示能力进行了排序。

    

  三种不同的 Aggregate:

    • sum:学习全部的标签以及数量,可以学习精确的结构信息(不仅保存了分布信息,还保存了类别信息);[ 蓝色:4个;红色:2 个  ] 
    • mean:学习标签的比例(比如两个图标签比例相同,但是节点有倍数关系),偏向学习分布信息;[ 蓝色:$4/6=2/3$ 的比例;红色:$2/6=1/3$ 的比例  ] 
    • max:学习最大标签,忽略多样,偏向学习有代表性的元素信息;[ 两类(类内相同),所以各一个  ] 

  Figure 3 说明了mean-pooling aggregators 和 max-pooling aggregators 无法区分的结构对。 

    

  在 Figure 3a 中:Every node has the same feature $a$ and $f(a)=h_a$ is the same across all nodes.

    • mean:左 $\frac{1}{2}(h_a+h_a)=h_a$ ,右:$\frac{1}{3}(h_a+h_a+h_a)=h_a$,无法区分;
    • max:左 $h_a$ , 右 $h_a$ 无法区分;
    • sum:左 $2h_a$ , 右 $3h_a$ , 可以区分;

  在 Figure 3b 中:Let $h_{\text {color }}(r \text { for red, } g \text { for green })$ denote node features transformed by $f $. 

    • mean: 左 $ \frac{1}{2}(h_r+h_g)$ ,右: $\frac{1}{3}(h_g+2h_r) $ ,可以区分;
    • max : 左 $max (h_r, h_g) $ ,右: $max (h_g, h_r, h_r) $ ,无法区分;
    • sum: 左 $sum(h_r+h_g)$ , 右 $sum(2 h_r+h_g)$ , 可以区分;

  在 Figure 3c 中:

    • mean:左 $\frac{1}{2}(h_r+h_g) $ ,右:$\frac{1}{4}(2 h_g+2 h_r) $ ,无法区分;
    • max:左 $\max (h_g, h_g, h_r, h_r)$ ,右:$\max (h_g, h_r)$ ,无法区分;
    • sum:左 $h_r+h_g$ ,右:$2 h_r+2 h_g$ ,可以区分;

5.3 Mean learns distrubutions

   旨在说明等比例 multiset ,使用 mean 是无法区分的。

  Corollary 8. Assume  $\mathcal{X}$  is countable. There exists a function  $f: \mathcal{X} \rightarrow \mathbb{R}^{n}$  so that for  $h(X)=   \frac{1}{|X|} \sum\limits _{x \in X} f(x), h\left(X_{1}\right)=h\left(X_{2}\right)$  if and only if multisets  $X_{1}$  and  $X_{2}$  have the same distribution. That is, assuming  $\left|X_{2}\right| \geq\left|X_{1}\right| , we have  X_{1}=(S, m)$  and  $X_{2}=(S, k \cdot m)$  for some $k \in \mathbb{N}_{\geq 1}$ .

5.4 Max-pooling learns sets with distinct elements

  Max-pooling 阐述的是,只要决定性元素(max value)一样,其他元素是否考虑无关紧要。显然这是不合理的。

  Corollary 9. Assume  $\mathcal{X}$  is countable. Then there exists a function  $f: \mathcal{X} \rightarrow \mathbb{R}^{\infty}$  so that for  ${\small h(X)=\underset{x \in X}{max} f(x), h\left(X_{1}\right)=h\left(X_{2}\right)} $  if and only if  $X_{1}$  and  $X_{2}$  have the same underlying set.

6 Experiments

6.1 Training set performance of GINs

    

  在训练中,GIN 和WL test 一样,可以拟合所有数据集,这表说了 GIN 表达能力达到了上限

6.2 Generalization ability of GNNs

    

    • GIN-0 比GIN-eps 泛化能力强:可能是因为更简单的缘故;
    • GIN 比 WL test 效果好:因为GIN进一步考虑了结构相似性,即WL test 最终是one-hot输出,而GIN是将WL test映射到低维的embedding;
    • max 在无节点特征的图(用度来表示特征)基本无效;

7 Conclusion

  本文主要 基于对 graph分类,证明了 sum 比 mean 、max 效果好,但是不能说明在node 分类上也是这样的效果,另外可能优先场景会更关注邻域特征分布, 或者代表性, 故需要都加入进来实验。

 

修改历史

2021-03-15 创建文章
2022-06-10 修订文章,大整理

 

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posted @ 2022-03-05 16:32  图神经网络  阅读(3551)  评论(0编辑  收藏  举报
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