2023年2月9日
DNA甲基化芯片分析01: 使用methylumi和limma分析27K DNA甲基化芯片数据
摘要： 前言 27K的数据是很老的芯片数据，但是客户有需求就要找方法分析，主流的DNA甲基化芯片R包minfi和champ都只支持450K和850K的芯片。所以在bioconductor中搜索到了methylumi这个包，可以从idat读数据，经过质控得到beta值矩阵，之后用limma做差异分析。 可以参 阅读全文
posted @ 2023-02-09 22:07 生信探索 阅读(148) 评论(0) 推荐(0) 编辑