02 2023 档案

文献阅读02: CD39抑制改变肿瘤微环境
摘要：![生信交流与合作请关注公众号@生信探索] 摘要 CD39可能作为膀胱癌（BC）潜在治疗靶点。抑制CD39能够抑制肿瘤生长和延长生存时间。通过单细胞测序发现CD39抑制介导了肿瘤微环境的改变。 背景 CD39是膜外三磷酸腺苷二磷酸水解酶-1，由ENTPD1编码。 功能：CD39与胞外ATP（extr 阅读全文
posted @ 2023-02-17 09:05 生信探索 阅读(147) 评论(0) 推荐(0) 编辑
03.Python Dash网页开发：多页面网站制作
摘要：需求：写一个多网页的网站，包括header、footer、菜单包括主页home、博客blog（外部链接到博客）、about（自我介绍页面） home页面包括一个旋转木马（几张图片循环播放）、再下边单个APP点击后进入可以分析）。 其中第一个APP是shiny APP，用外部网址链接到shiny网站， 阅读全文
posted @ 2023-02-13 19:59 生信探索 阅读(273) 评论(0) 推荐(0) 编辑
DNA甲基化芯片分析01: 使用methylumi和limma分析27K DNA甲基化芯片数据
摘要：前言 27K的数据是很老的芯片数据，但是客户有需求就要找方法分析，主流的DNA甲基化芯片R包minfi和champ都只支持450K和850K的芯片。所以在bioconductor中搜索到了methylumi这个包，可以从idat读数据，经过质控得到beta值矩阵，之后用limma做差异分析。 可以参 阅读全文
posted @ 2023-02-09 22:07 生信探索 阅读(195) 评论(0) 推荐(0) 编辑
文献阅读01:由I类HLA转录缺失导致的联合免疫治疗的获得性癌症耐药性
摘要：背景 Merkel cell carcinoma：梅克尔细胞癌又名皮肤小梁状癌、原发性皮肤神经内分泌癌、皮肤原发性小细胞癌及皮肤APUD瘤。 HLA：MHC基因产物在不同细胞表面表达，通常称之为MHC分子或主要组织相容性抗原，对抗原递呈和免疫信号传递起关键作用。人的MHC又叫HLA。 HLA抗原根据 阅读全文
posted @ 2023-02-06 21:20 生信探索 阅读(81) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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