python pandas groupby
转自 : https://blog.csdn.net/Leonis_v/article/details/51832916
pandas提供了一个灵活高效的groupby功能,它使你能以一种自然的方式对数据集进行切片、切块、摘要等操作。根据一个或多个键(可以是函数、数组或DataFrame列名)拆分pandas对象。计算分组摘要统计,如计数、平均值、标准差,或用户自定义函数。对DataFrame的列应用各种各样的函数。应用组内转换或其他运算,如规格化、线性回归、排名或选取子集等。计算透视表或交叉表。执行分位数分析以及其他分组分析。
1、首先来看看下面这个非常简单的表格型数据集(以DataFrame的形式):
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>>> import pandas as pd >>> df = pd.DataFrame({ 'key1' :[ 'a' , 'a' , 'b' , 'b' , 'a' ], ... 'key2' :[ 'one' , 'two' , 'one' , 'two' , 'one' ], ... 'data1' :np.random.randn( 5 ), ... 'data2' :np.random.randn( 5 )}) >>> df data1 data2 key1 key2 0 - 0.410673 0.519378 a one 1 - 2.120793 0.199074 a two 2 0.642216 - 0.143671 b one 3 0.975133 - 0.592994 b two 4 - 1.017495 - 0.530459 a one |
假设你想要按key1进行分组,并计算data1列的平均值,我们可以访问data1,并根据key1调用groupby:
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>>> grouped = df[ 'data1' ].groupby(df[ 'key1' ]) >>> grouped <pandas.core.groupby.SeriesGroupBy object at 0x04120D70 > |
变量grouped是一个GroupBy对象,它实际上还没有进行任何计算,只是含有一些有关分组键df['key1']的中间数据而已,然后我们可以调用GroupBy的mean方法来计算分组平均值:
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>>> grouped.mean() key1 a - 1.182987 b 0.808674 dtype: float64 |
说明:数据(Series)根据分组键进行了聚合,产生了一个新的Series,其索引为key1列中的唯一值。之所以结果中索引的名称为key1,是因为原始DataFrame的列df['key1']就叫这个名字。
2、如果我们一次传入多个数组,就会得到不同的结果:
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>>> means = df[ 'data1' ].groupby([df[ 'key1' ], df[ 'key2' ]]).mean() >>> means key1 key2 a one - 0.714084 two - 2.120793 b one 0.642216 two 0.975133 dtype: float64 |
通过两个键对数据进行了分组,得到的Series具有一个层次化索引(由唯一的键对组成):
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>>> means.unstack() key2 one two key1 a - 0.714084 - 2.120793 b 0.642216 0.975133 |
在上面这些示例中,分组键均为Series。实际上,分组键可以是任何长度适当的数组:
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>>> states = np.array([ 'Ohio' , 'California' , 'California' , 'Ohio' , 'Ohio' ]) >>> years = np.array([ 2005 , 2005 , 2006 , 2005 , 2006 ]) >>> df[ 'data1' ].groupby([states, years]).mean() California 2005 - 2.120793 2006 0.642216 Ohio 2005 0.282230 2006 - 1.017495 dtype: float64 |
3、此外,你还可以将列名(可以是字符串、数字或其他Python对象)用作分组将:
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>>> df.groupby( 'key1' ).mean() data1 data2 key1 a - 1.182987 0.062665 b 0.808674 - 0.368333 >>> df.groupby([ 'key1' , 'key2' ]).mean() data1 data2 key1 key2 a one - 0.714084 - 0.005540 two - 2.120793 0.199074 b one 0.642216 - 0.143671 two 0.975133 - 0.592994 |
说明:在执行df.groupby('key1').mean()时,结果中没有key2列。这是因为df['key2']不是数值数据,所以被从结果中排除了。默认情况下,所有数值列都会被聚合,虽然有时可能会被过滤为一个子集。
无论你准备拿groupby做什么,都有可能会用到GroupBy的size方法,它可以返回一个含有分组大小的Series:
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>>> df.groupby([ 'key1' , 'key2' ]).size() key1 key2 a one 2 two 1 b one 1 two 1 dtype: int64 |
注意:分组键中的任何缺失值都会被排除在结果之外。
4、对分组进行迭代
GroupBy对象支持迭代,可以产生一组二元元组(由分组名和数据块组成)。看看下面这个简单的数据集:
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>>> for name, group in df.groupby( 'key1' ): ... print (name) ... print (group) ... a data1 data2 key1 key2 0 - 0.410673 0.519378 a one 1 - 2.120793 0.199074 a two 4 - 1.017495 - 0.530459 a one b data1 data2 key1 key2 2 0.642216 - 0.143671 b one 3 0.975133 - 0.592994 b two |
对于多重键的情况,元组的第一个元素将会是由键值组成的元组:
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>>> for (k1, k2), group in df.groupby([ 'key1' , 'key2' ]): ... print k1, k2 ... print group ... a one data1 data2 key1 key2 0 - 0.410673 0.519378 a one 4 - 1.017495 - 0.530459 a one a two data1 data2 key1 key2 1 - 2.120793 0.199074 a two b one data1 data2 key1 key2 2 0.642216 - 0.143671 b one b two data1 data2 key1 key2 3 0.975133 - 0.592994 b two |
当然,你可以对这些数据片段做任何操作。有一个你可能会觉得有用的运算:将这些数据片段做成一个字典:
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>>> pieces = dict ( list (df.groupby( 'key1' ))) >>> pieces[ 'b' ] data1 data2 key1 key2 2 0.642216 - 0.143671 b one 3 0.975133 - 0.592994 b two >>> df.groupby( 'key1' ) <pandas.core.groupby.DataFrameGroupBy object at 0x0413AE30 > >>> list (df.groupby( 'key1' )) [( 'a' , data1 data2 key1 key2 0 - 0.410673 0.519378 a one 1 - 2.120793 0.199074 a two 4 - 1.017495 - 0.530459 a one), ( 'b' , data1 data2 key1 key2 2 0.642216 - 0.143671 b one 3 0.975133 - 0.592994 b two)] |
groupby默认是在axis=0上进行分组的,通过设置也可以在其他任何轴上进行分组。那上面例子中的df来说,我们可以根据dtype对列进行分组:
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>>> df.dtypes data1 float64 data2 float64 key1 object key2 object dtype: object >>> grouped = df.groupby(df.dtypes, axis = 1 ) >>> dict ( list (grouped)) {dtype( 'O' ): key1 key2 0 a one 1 a two 2 b one 3 b two 4 a one, dtype( 'float64' ): data1 data2 0 - 0.410673 0.519378 1 - 2.120793 0.199074 2 0.642216 - 0.143671 3 0.975133 - 0.592994 4 - 1.017495 - 0.530459 } |
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>>> grouped <pandas.core.groupby.DataFrameGroupBy object at 0x041288F0 > >>> list (grouped) [(dtype( 'float64' ), data1 data2 0 - 0.410673 0.519378 1 - 2.120793 0.199074 2 0.642216 - 0.143671 3 0.975133 - 0.592994 4 - 1.017495 - 0.530459 ), (dtype( 'O' ), key1 key2 0 a one 1 a two 2 b one 3 b two 4 a one)] |
5、选取一个或一组列
对于由DataFrame产生的GroupBy对象,如果用一个(单个字符串)或一组(字符串数组)列名对其进行索引,就能实现选取部分列进行聚合的目的,即:
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>>> df.groupby( 'key1' )[ 'data1' ] <pandas.core.groupby.SeriesGroupBy object at 0x06615FD0 > >>> df.groupby( 'key1' )[ 'data2' ] <pandas.core.groupby.SeriesGroupBy object at 0x06615CB0 > >>> df.groupby( 'key1' )[[ 'data2' ]] <pandas.core.groupby.DataFrameGroupBy object at 0x06615F10 > |
和以下代码是等效的:
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>>> df[ 'data1' ].groupby([df[ 'key1' ]]) <pandas.core.groupby.SeriesGroupBy object at 0x06615FD0 > >>> df[[ 'data2' ]].groupby([df[ 'key1' ]]) <pandas.core.groupby.DataFrameGroupBy object at 0x06615F10 > >>> df[ 'data2' ].groupby([df[ 'key1' ]]) <pandas.core.groupby.SeriesGroupBy object at 0x06615E30 > |
尤其对于大数据集,很可能只需要对部分列进行聚合。例如,在前面那个数据集中,如果只需计算data2列的平均值并以DataFrame形式得到结果,代码如下:
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>>> df.groupby([ 'key1' , 'key2' ])[[ 'data2' ]].mean() data2 key1 key2 a one - 0.005540 two 0.199074 b one - 0.143671 two - 0.592994 >>> df.groupby([ 'key1' , 'key2' ])[ 'data2' ].mean() key1 key2 a one - 0.005540 two 0.199074 b one - 0.143671 two - 0.592994 Name: data2, dtype: float64 |
这种索引操作所返回的对象是一个已分组的DataFrame(如果传入的是列表或数组)或已分组的Series(如果传入的是标量形式的单个列明):
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>>> s_grouped = df.groupby([ 'key1' , 'key2' ])[ 'data2' ] >>> s_grouped <pandas.core.groupby.SeriesGroupBy object at 0x06615B10 > >>> s_grouped.mean() key1 key2 a one - 0.005540 two 0.199074 b one - 0.143671 two - 0.592994 Name: data2, dtype: float64 |
6、通过字典或Series进行分组
除数组以外,分组信息还可以其他形式存在,来看一个DataFrame示例:
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>>> people = pd.DataFrame(np.random.randn( 5 , 5 ), ... columns = [ 'a' , 'b' , 'c' , 'd' , 'e' ], ... index = [ 'Joe' , 'Steve' , 'Wes' , 'Jim' , 'Travis' ] ... ) >>> people a b c d e Joe 0.306336 - 0.139431 0.210028 - 1.489001 - 0.172998 Steve 0.998335 0.494229 0.337624 - 1.222726 - 0.402655 Wes 1.415329 0.450839 - 1.052199 0.731721 0.317225 Jim 0.550551 3.201369 0.669713 0.725751 0.577687 Travis - 2.013278 - 2.010304 0.117713 - 0.545000 - 1.228323 >>> people.ix[ 2 : 3 , [ 'b' , 'c' ]] = np.nan |
假设已知列的分组关系,并希望根据分组计算列的总计:
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>>> mapping = { 'a' : 'red' , 'b' : 'red' , 'c' : 'blue' , ... 'd' : 'blue' , 'e' : 'red' , 'f' : 'orange' } >>> mapping { 'a' : 'red' , 'c' : 'blue' , 'b' : 'red' , 'e' : 'red' , 'd' : 'blue' , 'f' : 'orange' } >>> type (mapping) < type 'dict' > |
现在,只需将这个字典传给groupby即可:
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>>> by_column = people.groupby(mapping, axis = 1 ) >>> by_column <pandas.core.groupby.DataFrameGroupBy object at 0x066150F0 > >>> by_column. sum () blue red Joe - 1.278973 - 0.006092 Steve - 0.885102 1.089908 Wes 0.731721 1.732554 Jim 1.395465 4.329606 Travis - 0.427287 - 5.251905 |
Series也有同样的功能,它可以被看做一个固定大小的映射。对于上面那个例子,如果用Series作为分组键,则pandas会检查Series以确保其索引跟分组轴是对齐的:
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>>> map_series = pd.Series(mapping) >>> map_series a red b red c blue d blue e red f orange dtype: object >>> people.groupby(map_series, axis = 1 ).count() blue red Joe 2 3 Steve 2 3 Wes 1 2 Jim 2 3 Travis 2 3 |
7、通过函数进行分组
相较于字典或Series,Python函数在定义分组映射关系时可以更有创意且更为抽象。任何被当做分组键的函数都会在各个索引值上被调用一次,其返回值就会被用作分组名称。
具体点说,以DataFrame为例,其索引值为人的名字。假设你希望根据人名的长度进行分组,虽然可以求取一个字符串长度数组,但其实仅仅传入len函数即可:
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>> people.groupby( len ). sum () a b c d e 3 2.272216 3.061938 0.879741 - 0.031529 0.721914 5 0.998335 0.494229 0.337624 - 1.222726 - 0.402655 6 - 2.013278 - 2.010304 0.117713 - 0.545000 - 1.228323 |
将函数跟数组、列表、字典、Series混合使用也不是问题,因为任何东西最终都会被转换为数组:
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>>> key_list = [ 'one' , 'one' , 'one' , 'two' , 'two' ] >>> people.groupby([ len , key_list]). min () a b c d e 3 one 0.306336 - 0.139431 0.210028 - 1.489001 - 0.172998 two 0.550551 3.201369 0.669713 0.725751 0.577687 5 one 0.998335 0.494229 0.337624 - 1.222726 - 0.402655 6 two - 2.013278 - 2.010304 0.117713 - 0.545000 - 1.228323 |
8、根据索引级别分组
层次化索引数据集最方便的地方在于它能够根据索引级别进行聚合。要实现该目的,通过level关键字传入级别编号或名称即可:
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>>> columns = pd.MultiIndex.from_arrays([[ 'US' , 'US' , 'US' , 'JP' , 'JP' ], ... [ 1 , 3 , 5 , 1 , 3 ]], names = [ 'cty' , 'tenor' ]) >>> columns MultiIndex [US 1 , 3 , 5 , JP 1 , 3 ] >>> hier_df = pd.DataFrame(np.random.randn( 4 , 5 ), columns = columns) >>> hier_df cty US JP tenor 1 3 5 1 3 0 - 0.166600 0.248159 - 0.082408 - 0.710841 - 0.097131 1 - 1.762270 0.687458 1.235950 - 1.407513 1.304055 2 1.089944 0.258175 - 0.749688 - 0.851948 1.687768 3 - 0.378311 - 0.078268 0.247147 - 0.018829 0.744540 >>> hier_df.groupby(level = 'cty' , axis = 1 ).count() cty JP US 0 2 3 1 2 3 2 2 3 3 2 3 |