摘要: 如XP-EHH、XP-CLR、fst 参考来源群体遗传|根据SNP验证自然选择-XPCLR分析 (qq.com) 参考牛津大学Nick Hardin写的python3版本的XPCLR程序 XPCLR 英文全称是cross-population composite likelihood ratio , 阅读全文
posted @ 2022-06-01 16:16 心跳2022 阅读(561) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: #利用已有数据组建新的矩阵 v1 <- c(1:4) #创建名为v1的向量 v2 <- c(5:8) #创建名为v2的向量 m5 <- rbind(v1,v2) #将向量v1和v2按行合并为一个矩阵 m6 <- cbind(v1,v2) #将向量v1和v2按列合并为一个矩阵 #参考R语言中常见的几种 阅读全文
posted @ 2022-06-01 16:12 心跳2022 阅读(623) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 基本概念:基于染色体区域内SNP分型结果判定对应的拷贝数 纵坐标对应的是荧光强度,每一个黑点代表基不同位点基因分型的结果(不同等位基因荧光强度综合均值),A代表0分,B代表1分,AAA表示0分 、AB表示0.5、B表示1、A表示0。 (根据荧光强度值来判定,当数字如果一个区域内荧光强度值很奇怪,如0 阅读全文
posted @ 2022-06-01 16:01 心跳2022 阅读(597) 评论(0) 推荐(0) 编辑