大数据算法:排位问题

此文已由作者叶林宝授权网易云社区发布。

欢迎访问网易云社区,了解更多网易技术产品运营经验。


问题描述

(1)如上图是一张表, 第一行是列名,除第一列是string类型外, 其它列都是double类型。第二行开始,每行代表一条记录

(2)需求:输入一个数组例如[2, 4](后文中, 简称排位数组), 要求输出每列(除第一列)按升序取出第2、第4位的值。 结果如下图所示:

解决算法

一、迭代计算

简述:

简单来说, 就是迭代每一列, 然后迭代每一行, 然后找出满足相应排名的数据

代码:

/**
    * 筛选出每个列满足给定的排位数组中要求的位置上的取值, 简单粗暴方案
    *
    * @param dataFrame 数据源
    * @param ranks 排位数组
    * @return
    */
  def findRankStatistics(dataFrame: DataFrame,  ranks: List[Long]): Map[Int, Iterable[Double]] = {
    require(ranks.forall(_ > 0))    // 获取字段个数
    val numberOfColumns = dataFrame.schema.length
    var i = 0
    // 保存结果, key为列索引, value为该列满足排序数组的值构成的列表
    var result = Map[Int, Iterable[Double]]()    while (i < numberOfColumns) {      // 每轮迭代, 只filter出该列数据
      val col = dataFrame.rdd.map(row => row.getDouble(i))
      val sortedCol: RDD[(Double, Long)] = col.sortBy(v => v).zipWithIndex()      // 只过滤出满足排位的数值
      val ranksOnly = sortedCol.filter { case (colValue, index) => ranks.contains(index + 1)}.keys
      val list = ranksOnly.collect()
      result += (i -> list)
      i += 1
    }
    result
  }

分析:

缺点:效率低,  每列排位的计算是串行的。

二、 groupByKey

简述:

解决方案一, 循环迭代每一列带来的效率问题, 列与列之间的计算本质上互不影响的, 所以, 方案二的改进方法是, 列索引作为key , 每行的值作为value,依据key的hash值shuffle到不同的partition, 并行计算每个partition

代码:

/**
    * 筛选出每个列满足给定的排位数组中要求的位置上的数值, groupByKey方案
    *
    * @param dataFrame 数据源
    * @param ranks  排位数组
    * @return
    */
  def findRankStatistics(dataFrame: DataFrame, ranks: List[Long]): Map[Int, Iterable[Double]] = {
    require(ranks.forall(_ > 0))    // 将源数据 依据列索引(后文简称field_index)和每行对应的数值(后文简称field_value)转换为pairRDD
    val pairRDD: RDD[(Int, Double)] = mapToKeyValuePairs(dataFrame)    // 依据field_index 聚合相应filed_value
    val groupColumns: RDD[(Int, Iterable[Double])] = pairRDD.groupByKey()    
    // 对每个field_index, 计算其相应的field_values, 过滤出满足排位要求的数值
    groupColumns.mapValues(
      iter => {        // 排序field_values
        val sortedIter = iter.toArray.sorted
        sortedIter.toIterable.zipWithIndex.flatMap({          case (colValue, index) =>            if (ranks.contains(index + 1)) {
              Iterator(colValue)
            } else {
              Iterator.empty
            }
        })
      }).collectAsMap()
  }

分析:

这种方案只使用数数据规模较小(指的是行数较少)的数据, 对于大规模数据, groupByKey操作, 容易oom。

groupByKey执行效果如下图所示:

groupByKey会在内存中暂存所有的<key, values>, 所以, 对于同一个key, value较多的情况, 容易引起executor端oom

三、二次排序

简述:

方案二, 除了容易引起executor端oom问题, 还有另外一个问题, 排序操作时在shuffle后, 在executor进行的。spark sort based shuffle 支持在shuffle阶段,直接对key进行排序。因此,可通过二次排序提高效率。

算法思想:

(1)将df的每行数据展开为(field_index, field_value)格式, 再转换为((field_index, field_value), 1)

(2)自定义分区器, 根据((field_index, field_value), 1)中的field_index分区

(3)调用repartitionAndSortWithinPartitions函数, 依据field_index分区, 依据(field_index, field_value)排序

(4)过滤出各列满足配位需求的值

(5)转换为所需输出格式

代码:

/**
    * 筛选出每个列满足给定的排位数组中要求的位置上的数值, 二次排序方案
    * @param dataFrame 数据源
    * @param targetRanks 排位数组
    * @param partitions 分区数
    * @return
    */
  def findRankStatistics(dataFrame: DataFrame, targetRanks: List[Long], partitions: Int) = {    // 将df的每行数据展开为(field_index, field_value)格式, 再转换为((field_index, field_value), 1)
    // 即最终为pariRdd
    // 其中“1”只是pairRdd中value的一个占位符, 对最终计算结果不产生影响
    val pairRDD: RDD[((Int, Double), Int)] = mapToKeyValuePairs(dataFrame).map((_, 1))    //自定义分区器, 根据((field_index, field_value), 1)中的field_index分区
    val partitioner = new ColumnIndexPartition(partitions)    //根据((field_index, field_value), 1)中的(field_index, field_value)排序
    val sorted = pairRDD.repartitionAndSortWithinPartitions(partitioner)    //过滤出所需数据
    val filterForTargetIndex: RDD[(Int, Double)] =
      sorted.mapPartitions(iter => {
        var currentColumnIndex = -1
        var runningTotal = 0
         // 过滤出各列满足配位需求的值
        iter.filter({          case (((colIndex, value), _)) =>            // 同一个分区中的数据,可能包含多个field_index即多列数据, 当遍历到新的field_index时, 需要重置计数器runningTotal
            if (colIndex != currentColumnIndex) {
              currentColumnIndex = colIndex
              runningTotal = 1
            } else {
              runningTotal += 1
            }            //保留满足排位的数值
            targetRanks.contains(runningTotal)
        })
      }.map(_._1), preservesPartitioning = true)    // 转换为所需输出格式
    groupSorted(filterForTargetIndex.collect())
  }  // 隐式转换, 对于二元数组, 先按第一排序, 再按第二个排序
  implicit val ordering: Ordering[(K, S)] = Ordering.Tuple2  /**
    * 将df的每行数据展开为(field_index, field_value)格式, 再转换为((field_index, field_value), 1)
    * @param dataFrame
    * @return
    */
  def mapToKeyValuePairs(dataFrame: DataFrame): RDD[(Int, Double)] = {    // 获取字段个数
    val rowLength = dataFrame.schema.length
    dataFrame.rdd.flatMap(
      row => Range(0, rowLength).map(i => (i, row.getDouble(i)))
    )
  }  /**
    * 自定义分区器, 根据((field_index, field_value), 1)中的field_index分区
    * @param numPartitions 分区个数
    */
  class ColumnIndexPartition(override val numPartitions: Int) extends Partitioner {
    require(numPartitions >= 0, s"Number of partitions " + s"($numPartitions) cannot be negative.")    override def getPartition(key: Any): Int = {
      val k = key.asInstanceOf[(Int, Double)]
      Math.abs(k._1) % numPartitions //hashcode of column index
    }
  }  /**
    * 转换为所需输出格式
    * 将it聚合为map, 其中key为field_index, value为同一个field_index下的field_value组成的数组
    * @param it 数组中的元素为(field_index, field_value)
    * @return
    */
  private def groupSorted(it: Array[(Int, Double)]): Map[Int, Iterable[Double]] = {
    val res = List[(Int, ArrayBuffer[Double])]()
    it.foldLeft(res)((list, next) => list match {      case Nil =>
        val (firstKey, value) = next        List((firstKey, ArrayBuffer(value)))      case head :: rest =>
        val (curKey, valueBuf) = head        val (firstKey, value) = next        if (!firstKey.equals(curKey)) {
          (firstKey, ArrayBuffer(value)) :: list
        } else {
          valueBuf.append(value)
          list
        }
    }).map { case (key, buf) => (key, buf.toIterable) }.toMap
  }


分析:

相比于方案二, 这种方案将数据排序下推到shuffle阶段, 然后对每个partitions的数据,迭代每条记录过滤出所需数据, 避免了executor将所有数据加载到内存中。但是, 在shuffle阶段, 也可能出现由于数据量过大(数据本身行数较多, 且不同的key都打到同一个executor), 特别是重复数据特别多的情况下, 导致在二次排序过程中oom。



免费体验云安全(易盾)内容安全、验证码等服务

更多网易技术、产品、运营经验分享请点击


相关文章:
【推荐】 django项目在uwsgi+nginx上部署遇到的坑
【推荐】 使用QUIC

posted @ 2018-10-31 09:05  网易数帆  阅读(319)  评论(0编辑  收藏  举报