大数据算法:排位问题
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问题描述
(1)如上图是一张表, 第一行是列名,除第一列是string类型外, 其它列都是double类型。第二行开始,每行代表一条记录
(2)需求:输入一个数组例如[2, 4](后文中, 简称排位数组), 要求输出每列(除第一列)按升序取出第2、第4位的值。 结果如下图所示:
解决算法
一、迭代计算
简述:
简单来说, 就是迭代每一列, 然后迭代每一行, 然后找出满足相应排名的数据
代码:
/** * 筛选出每个列满足给定的排位数组中要求的位置上的取值, 简单粗暴方案 * * @param dataFrame 数据源 * @param ranks 排位数组 * @return */ def findRankStatistics(dataFrame: DataFrame, ranks: List[Long]): Map[Int, Iterable[Double]] = { require(ranks.forall(_ > 0)) // 获取字段个数 val numberOfColumns = dataFrame.schema.length var i = 0 // 保存结果, key为列索引, value为该列满足排序数组的值构成的列表 var result = Map[Int, Iterable[Double]]() while (i < numberOfColumns) { // 每轮迭代, 只filter出该列数据 val col = dataFrame.rdd.map(row => row.getDouble(i)) val sortedCol: RDD[(Double, Long)] = col.sortBy(v => v).zipWithIndex() // 只过滤出满足排位的数值 val ranksOnly = sortedCol.filter { case (colValue, index) => ranks.contains(index + 1)}.keys val list = ranksOnly.collect() result += (i -> list) i += 1 } result }
分析:
缺点:效率低, 每列排位的计算是串行的。
二、 groupByKey
简述:
解决方案一, 循环迭代每一列带来的效率问题, 列与列之间的计算本质上互不影响的, 所以, 方案二的改进方法是, 列索引作为key , 每行的值作为value,依据key的hash值shuffle到不同的partition, 并行计算每个partition
代码:
/** * 筛选出每个列满足给定的排位数组中要求的位置上的数值, groupByKey方案 * * @param dataFrame 数据源 * @param ranks 排位数组 * @return */ def findRankStatistics(dataFrame: DataFrame, ranks: List[Long]): Map[Int, Iterable[Double]] = { require(ranks.forall(_ > 0)) // 将源数据 依据列索引(后文简称field_index)和每行对应的数值(后文简称field_value)转换为pairRDD val pairRDD: RDD[(Int, Double)] = mapToKeyValuePairs(dataFrame) // 依据field_index 聚合相应filed_value val groupColumns: RDD[(Int, Iterable[Double])] = pairRDD.groupByKey() // 对每个field_index, 计算其相应的field_values, 过滤出满足排位要求的数值 groupColumns.mapValues( iter => { // 排序field_values val sortedIter = iter.toArray.sorted sortedIter.toIterable.zipWithIndex.flatMap({ case (colValue, index) => if (ranks.contains(index + 1)) { Iterator(colValue) } else { Iterator.empty } }) }).collectAsMap() }
分析:
这种方案只使用数数据规模较小(指的是行数较少)的数据, 对于大规模数据, groupByKey操作, 容易oom。
groupByKey执行效果如下图所示:
groupByKey会在内存中暂存所有的<key, values>, 所以, 对于同一个key, value较多的情况, 容易引起executor端oom
三、二次排序
简述:
方案二, 除了容易引起executor端oom问题, 还有另外一个问题, 排序操作时在shuffle后, 在executor进行的。spark sort based shuffle 支持在shuffle阶段,直接对key进行排序。因此,可通过二次排序提高效率。
算法思想:
(1)将df的每行数据展开为(field_index, field_value)格式, 再转换为((field_index, field_value), 1)
(2)自定义分区器, 根据((field_index, field_value), 1)中的field_index分区
(3)调用repartitionAndSortWithinPartitions函数, 依据field_index分区, 依据(field_index, field_value)排序
(4)过滤出各列满足配位需求的值
(5)转换为所需输出格式
代码:
/** * 筛选出每个列满足给定的排位数组中要求的位置上的数值, 二次排序方案 * @param dataFrame 数据源 * @param targetRanks 排位数组 * @param partitions 分区数 * @return */ def findRankStatistics(dataFrame: DataFrame, targetRanks: List[Long], partitions: Int) = { // 将df的每行数据展开为(field_index, field_value)格式, 再转换为((field_index, field_value), 1) // 即最终为pariRdd // 其中“1”只是pairRdd中value的一个占位符, 对最终计算结果不产生影响 val pairRDD: RDD[((Int, Double), Int)] = mapToKeyValuePairs(dataFrame).map((_, 1)) //自定义分区器, 根据((field_index, field_value), 1)中的field_index分区 val partitioner = new ColumnIndexPartition(partitions) //根据((field_index, field_value), 1)中的(field_index, field_value)排序 val sorted = pairRDD.repartitionAndSortWithinPartitions(partitioner) //过滤出所需数据 val filterForTargetIndex: RDD[(Int, Double)] = sorted.mapPartitions(iter => { var currentColumnIndex = -1 var runningTotal = 0 // 过滤出各列满足配位需求的值 iter.filter({ case (((colIndex, value), _)) => // 同一个分区中的数据,可能包含多个field_index即多列数据, 当遍历到新的field_index时, 需要重置计数器runningTotal if (colIndex != currentColumnIndex) { currentColumnIndex = colIndex runningTotal = 1 } else { runningTotal += 1 } //保留满足排位的数值 targetRanks.contains(runningTotal) }) }.map(_._1), preservesPartitioning = true) // 转换为所需输出格式 groupSorted(filterForTargetIndex.collect()) } // 隐式转换, 对于二元数组, 先按第一排序, 再按第二个排序 implicit val ordering: Ordering[(K, S)] = Ordering.Tuple2 /** * 将df的每行数据展开为(field_index, field_value)格式, 再转换为((field_index, field_value), 1) * @param dataFrame * @return */ def mapToKeyValuePairs(dataFrame: DataFrame): RDD[(Int, Double)] = { // 获取字段个数 val rowLength = dataFrame.schema.length dataFrame.rdd.flatMap( row => Range(0, rowLength).map(i => (i, row.getDouble(i))) ) } /** * 自定义分区器, 根据((field_index, field_value), 1)中的field_index分区 * @param numPartitions 分区个数 */ class ColumnIndexPartition(override val numPartitions: Int) extends Partitioner { require(numPartitions >= 0, s"Number of partitions " + s"($numPartitions) cannot be negative.") override def getPartition(key: Any): Int = { val k = key.asInstanceOf[(Int, Double)] Math.abs(k._1) % numPartitions //hashcode of column index } } /** * 转换为所需输出格式 * 将it聚合为map, 其中key为field_index, value为同一个field_index下的field_value组成的数组 * @param it 数组中的元素为(field_index, field_value) * @return */ private def groupSorted(it: Array[(Int, Double)]): Map[Int, Iterable[Double]] = { val res = List[(Int, ArrayBuffer[Double])]() it.foldLeft(res)((list, next) => list match { case Nil => val (firstKey, value) = next List((firstKey, ArrayBuffer(value))) case head :: rest => val (curKey, valueBuf) = head val (firstKey, value) = next if (!firstKey.equals(curKey)) { (firstKey, ArrayBuffer(value)) :: list } else { valueBuf.append(value) list } }).map { case (key, buf) => (key, buf.toIterable) }.toMap }
分析:
相比于方案二, 这种方案将数据排序下推到shuffle阶段, 然后对每个partitions的数据,迭代每条记录过滤出所需数据, 避免了executor将所有数据加载到内存中。但是, 在shuffle阶段, 也可能出现由于数据量过大(数据本身行数较多, 且不同的key都打到同一个executor), 特别是重复数据特别多的情况下, 导致在二次排序过程中oom。
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