随笔分类 - linux
tar -zxvf *.tar.gz 包 EOF等报错的解决办法
摘要：点击查看代码 wget --no-check-certificate --no-cookies --header "Cookie: oraclelicense=accept-securebackup-cookie" "http://cmprod1.cibio.unitn.it/databases/H
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linux 下rush使用可以并行执行一些操作
摘要：linux 下rush使用可以并行执行一些操作
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linux sbatch 提交jupyter
摘要：点击查看代码 ``` #!/bin/bash #SBATCH -p Batch2 #SBATCH -N 1 #SBATCH -n 1 #SBATCH -c 1 #SBATCH --job-name=jupyter #SBATCH --output=jupy.out #SBATCH --error=j
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blast 流程记录
摘要：##### 1. 对小鼠的蛋白序列进行建库 点击查看代码 ``` makeblastdb -in Mus_musculus.GRCm39.pep.all.fa -dbtype prot -parse_seqids -out ./mm.blast.db/index ``` ##### 2. 将自己的物
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sbatch 提交jupyter
摘要：点击查看代码 ``` #!/bin/bash #SBATCH -p Batch2 #SBATCH -N 1 #SBATCH -n 1 #SBATCH -c 1 #SBATCH --job-name=jupyter #SBATCH --output=jupy.out #SBATCH --error=j
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nohup setsid $ ...
摘要：参考链接：http://blog.lujun9972.win/blog/2018/04/20/nohup,setsid%E4%B8%8Edisown%E7%9A%84%E4%B8%8D%E5%90%8C%E4%B9%8B%E5%A4%84/index.html
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关于使用scp远程迁移miniconda环境导致jupyter pip pip3等不能使用的踩坑记录
摘要：由于没有管理权限，但工作又需要在计算节点配置一些基本的软件。终于只能通过scp将管理节点的conda环境整个打包到计算节点中。中间还是遇到一些麻烦的，但总算是解决了。 一 迁移anaconda 点击查看代码 scp -r 路径/miniconda3 用户@ip:要迁入得路径 二 修改配置文件 点击查
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关于该死的实验室服务器----镜像源
摘要：实验室的集群不知道是怎么回事，设置镜像总让人头疼，简单记录下可以用的镜像。 点击查看代码 channels: - defaults show_channel_urls: true default_channels: - http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anac
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解决ah <- AnnotationHub()报错
摘要：1. 报错内容： 点击查看代码 > ah <- AnnotationHub() Cannot connect to AnnotationHub server, using 'localHub=TRUE' instead Error in .updateHubDB(hub_bfc, .class, u
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关于使用实验室的集群搭建jupyter notebook的踩坑教程
摘要：实验室集群配置 实验室服务器是十多年前组装的，CentOS release 6.9，总共8个计算节点和一个fat01节点，含两块硬盘，存储大小分别为9T和35T。总体来说，还是满足日常的计算任务的。但是由于一些库文件实在是太旧了，所以还是谷歌了好久。简单的记录一下吧，方便之后整理。 ###具体过程
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