R(一): R基础知识
R 是一门拥有统计分析及作图功能的免费软件,主要用于数学建模、统计计算、数据处理、可视化等方向。据 IEEE Spectrum发布的2016年编程语言前10位排名来看,R语言由2015年排名第6位上升级2016年的第5位。目前在CRAN 上发布的算法包已经超过8000+多个。R体系涉及到高等数据、概率学、统计学、IT技术等多种知识的综合应用,虽然看起来超级复杂,但学过程还是得从基础开始。
解释:CRAN (The Comprehensive R Archive NetWork): 提供下载软件安装程序和相应软件包的网站,访问地址:https://www.r-project.org/
(附图2016年编程语言排名:来源于 http://spectrum.ieee.org/static/interactive-the-top-programming-languages-2016)
目录:
- R语言特点
- R语法规范
- R工作原理
- R数据类型
- R对象类别
- R对象判断转换
- R运算符
- R特殊值
- R循环语句
- R工作空间
- R帮助
R语言特点:
- 灵活、开放、免费
- R是一种解释性语言
- R区分大小写
- 帮助系统很赞,开发查找方便
- 数量众多的算法功能包(8000+扩展包),还不包括在github上的开发包
- 支持在UNIX、 Windows and MacOS多种系统上运行
- 高质量、广泛的统计分析、数据挖掘
R语法规范:
- 对象的命名以"."或字母开头,当以"."开头时,第二个字符不允许是数字
- 基本命令要么是表达式,要么是赋值。如果命令是表达式,它被解析后,结果显示在屏幕同时清空命令所占内存。赋值被解析后,将值传给变量结果不显示。
- 命令以";"分隔或另起一行,注释以"#"标注
- 当一条命令在一行结束时还没不完整,R会结出延续提示符,默认是"+"
- 与其它语言相比,R有个比较个性的赋值表达方式(即箭头赋值符号),至于此表达方式的来源,在谢老师的一篇文章中有介绍,请参见 (http://yihui.name/cn/2012/09/equal-and-arrow/)
- 开发过程中的编码规范约定,可参见google的R语言编码风格指南,如下图(详细参见:http://bbs.pinggu.org/thread-1410518-1-1.html)
R工作原理:
- 当R在运行时,所有的变量、数据、函数及结果都是以对象的形式存在于计算机的活动内存中,期间进行的所有操作都是针对活动内存中的对象,如下示意图
- 用户通过输入一些命令调用函数,分析得出的结果可以直接显示在屏幕上,也可以直接存入某个对象或写入磁盘,因为产生的数据本身就是一种对象,所以它们也能被视为数据并能象其它数据一样被处理分析。数据的输入文件可来源于本地磁盘,也可以是从远程服务端获取
- 上图中示意的所有的R 函数都包含在某个库里 (library), 我们从CRAN上下载的程序包被调用的时候,都要通过 library(包名)先加载到内存,再被使用,后面会详细介绍。
- 在R软件安装包里自带的 base 库是R的核心,在启动R时会自动加载,它包含了如:数据读写、数据运算等基本操作。
R数据类型:
- 数据型:Numeric
- 字符型:Character
- 逻辑型:Logical
- 因子型:Factor (表示不同类别,在下面的内容中会举例来说明)
- 复数型:Complex
R对象类别:
- 向量(Vector): 线性代数里面我记得又称为矢量,它表示一系统元素的组合。(注意:向量里面的元素类型必须一致,不一致时会自动进行转换),如下图示例
- 因子(Factor): 为处理分类数据提供的一种有效方法,概念难懂,结合以下代码说明
#取10名考生所在的省赋给变量province province <- c('四川','湖南','江苏','四川','四川','四川','湖南','江苏','湖南','江苏') #创建因子, 并查看因子输出结果 pf <- factor(province);pf #录入每位考生的分数 score <- c(95,86,84,92,84,79,86,99,85,90) #计算各省的平均成绩,并在屏幕显示 tapply(score,pf,mean)
-
输出结果如下图:(这样应该能明白了吧?)
- 矩阵(matrix): 一种特殊的数组,是向量在多维度下的一般形式。 用法: matrix(data = NA, nrow = 1, ncol = 1, byrow = FALSE, dimnames = NULL)
- data为必要的矩阵元素,nrow 为行数,ncol 为列数,注意nrow 与ncol 的乘积应为 矩阵元素个数,byrow 项控制排列元素时是否按行进行,默认是按列,dimnames 给定行和列的名称
- 示例代码: 1:12表示 1至12 的有序数字序列
> matrix(1:12,nrow = 3,ncol = 4,byrow = TRUE,dimnames = list(c("Row1","Row2","Row3"),c("col1","col2","col3","col4"))) col1 col2 col3 col4 Row1 1 2 3 4 Row2 5 6 7 8 Row3 9 10 11 12 >
- 数据框(dataframe): 和矩阵类似的结构,列可以是不同的对象。
- 使用data.frame函数来初始化一个对象,示例代码如下:
> duty <-data.frame(date=c("20160814","2016015","2016016"), + Name=c("tgzhu","zhangShan","LiShi"), + Tel=c("13606401549","13606401550","13606401551")) > duty date Name Tel 1 20160814 tgzhu 13606401549 2 2016015 zhangShan 13606401550 3 2016016 LiShi 13606401551 >
-
在通过读取本地文件、通过RODBC访问数据库访问的都是 data.frame对象,在后续会以单独的章节对其包含的操作进行介绍
- 列表(list): 一种泛化的向量,没有要求所有元素数型一致
- 通过 list 函数来初始化一个对象,示例代码如下:
#无tag 方式 list("tgzhu",16,TRUE) #带tag方式 list(name="tgzhu",workAge=16,goodMan=TRUE) #list 嵌套 list(name="tgzhu",workAge=16,address=list(address="JN",Tel="13606401550"))
-
list中元素的访问:list_name$tag_name、list_name[[tag_name]]、 list_name[[index]]
- 注意:list中元素的访问需要双层[[]],如果单层[index]或[tag_name]会访问到tag_name(或者index)与值本身,是个子list,而不仅仅是值;
- 双层[[]]中的只能是单一的tag_name或index,不能是类似[[1:3]]这样访问,而单层可以[1:3],提取出1~3作为子list
- 小结:
- R中的数据结构主要面向《线性代数》中的一些概念,如向量、矩阵等
- R中其实没有简单数据(数值型、逻辑型、字符型等),对于简单类型会自动看做长度为1的向量
R对象判断转换:
- R对象判断函数:其返回值:TRUE或FALSE
- is.numeric(): 是否数值型数据
- is.character(): 是否字符型数据
- is.vector(): 是否向量数据
- is.matrix(): 是否矩阵数据
- is.data.frame(): 是否数据框数据
- is.factor(): 是否因子数据
- is.logical(): 是否逻辑型数据
- 转换数据类型:函数将输入参数转换为对应的类型
- as.numeric()
- as.character()
- as.vector()
- as.matrix()
- as.data.frame()
- as.factor()
- as.logical()
- 简单示例如下
> a <- c(1,2,3);a [1] 1 2 3 > > is.numeric(a) [1] TRUE > > a<-as.character(a);a [1] "1" "2" "3" > > is.numeric(a) [1] FALSE
R运算符:
- 算术运算符: + - * /
- 逻辑运算符: <,<=,>,>=,==,!=, &, |, !
- 数学函数:
log,exp,sin,cos,tan,sqrt,max ,min,range,length,sum,prod,var
R循环语句:
- 条件语句:
if (expr1 ) expr2 else expr3
- 循环控制:for,repeat,while
for语法: for (name in expr1 ) expr2 其中name 是循环变量,expr1是一个向量表达式,而expr2常常是根据虚拟变量name 而设计的成组表达式。在name 访问expr1所有可以取到的值时,expr2都会运行
- 注意:相比其他程序语言,R代码里面很少使用for(),执行效率很低
- repeat expr, while (condition) expr
- 关键字break:可以用于结束任何循环,甚至是非常规的。它是结束repeat 循环的唯一办法。
- 关键字next:可以用来结束一次特定的循环,然后直接跳入"下一次"循环
R特殊值:
- 在某些情况下,向量的元素可能有残缺.R为确保所有数据都能被正确识别、计算或统计等,定义了一些特殊值数据
- NULL:空数据
- NA(not available):表示无数据
- NaN(Not a Number):表示非数字
- inf:数字除以0得到的值,无穷大
- 断一个object (x)是不是属于这些类型有相应的函数:
- is.null(x)
- is.na(x)
- is.nan(x)
- is.infinite(x)
R工作空间:
- 工作空间(workspace)就是当前R的工作环境,它储存着所有用户定义的对象(向量、矩阵、函数、数据框、列表) 。在一个R会话结束时,你可以将当前工作空间保存到一个镜像中,并在下次启动R时自动载入它
- 当前的工作目录(working directory)是R用来读取文件和保存结果的默认目录。使用函数getwd()来查看当前的工作目录,或使用函数setwd()设定当前的工作目录。
- 注意:如果需要读入一个不在当前工作目录下的文件,则需在调用语句中写明完整的路径。记得使用引号闭合这些目录名和文件名
- 用于管理工作空间的部分标准命令:
- getwd(): get working directory 显示当前的工作目录
- setwd("yourdirectory"): 修改当前的工作目录为你指定的目录地址
- ls(): 列出当前工作空间中的对象
- rm(objectlist): 移除(删除)一个或多个对象,变通一下: rm(list=ls()) 即表示删除工作空间内存中的所有对象
- rm(list=ls(pat=“^m”)): 删除内存中以m开头的变量
- options(): 显示或设置当前选项,这个命令很有用,在下面的章节会用到
- save.image("myfile") : 保存工作空间到文件myfile中(默认值为.RData)
- save(objectlist, file="myfile"): 保存指定对象到一个文件中
- load("myfile"): 读取一个工作空间到当前会话中(默认值为.RData),一些静态的数据文件也可保存为.rda文件,通过load加载到内存
- q(): 退出R
R帮助:
- help.start(): 打开所有已在本地安装的帮助文档
- help( 函数名) 或 ? 函数名 : 查看函数帮助文档
- help.search(“pattern”) 或 ??pattern: 函数搜索已在本地计算机安装的帮助文档
- 如果有些包是最近才安装的,则设置rebuild参数来刷新数据库,如:help.search(‘tree’,rebuild=TRUE)
- 示例:help(“bs”,try.all.package=TRUE) : 默认情况下,help只会在载入内存的包中进行搜索,选项 try.all.package = FASLSE,若设为TRUE,则可在所有包中进行搜索。在 这种情况下,不会显示函数 的帮助页面
- 若package未载入内存,而想查看帮助页面,可使用:help(“bs”,package=“splines”);
- apropos("yourSearchName"):找出所有名字中含有指定字符串的函数(仅加载到内存中的包中搜)