DNA 匹配
脱氧核糖核酸即常说的DNA,是一类带有遗传信息的生物大分子。它由4种主要的脱氧核苷酸(dAMP、dGMP、dCMT和dTMP)通过磷酸二酯键连接而成。这4种核苷酸可以分别记为:A、G、C、T。
DNA携带的遗传信息可以用形如:AGGTCGACTCCA.... 的串来表示。DNA在转录复制的过程中可能会发生随机的偏差,这才最终造就了生物的多样性。
为了简化问题,我们假设,DNA在复制的时候可能出现的偏差是(理论上,对每个碱基被复制时,都可能出现偏差):
1. 漏掉某个脱氧核苷酸。例如把 AGGT 复制成为:AGT
2. 错码,例如把 AGGT 复制成了:AGCT
3. 重码,例如把 AGGT 复制成了:AAGGT
如果某DNA串a,最少要经过 n 次出错,才能变为DNA串b,则称这两个DNA串的距离为 n。
例如:AGGTCATATTCC 与 CGGTCATATTC 的距离为 2
你的任务是:编写程序,找到两个DNA串的距离。
【输入、输出格式要求】
用户先输入整数n(n<100),表示接下来有2n行数据。
接下来输入的2n行每2行表示一组要比对的DNA。(每行数据长度<10000)
程序则输出n行,表示这n组DNA的距离。
例如:用户输入:
3
AGCTAAGGCCTT
AGCTAAGGCCT
AGCTAAGGCCTT
AGGCTAAGGCCTT
AGCTAAGGCCTT
AGCTTAAGGCTT
则程序应输出:
1
1
2
1 #include<stdio.h> 2 #include<string.h> 3 4 char a[110]; 5 char b[110]; 6 int dp[110][110]; 7 8 int main() 9 { 10 int i,j,t,n,m; 11 scanf("%d",&t); 12 while(t--) 13 { 14 scanf("%s%s",a,b); 15 n=strlen(a); 16 m=strlen(b); 17 memset(dp,0,sizeof(dp)); 18 for(i=0;i<=n;i++) 19 dp[i][0]=i; 20 for(i=0;i<=m;i++) 21 dp[0][i]=i; 22 for(i=1;i<=n;i++) 23 for(j=1;j<=m;j++) 24 { 25 if(a[i-1]==b[j-1]) dp[i][j]=dp[i-1][j-1]; 26 else 27 { 28 dp[i][j]=dp[i-1][j]+1<dp[i][j-1]+1?dp[i-1][j]+1:dp[i][j-1]+1; 29 dp[i][j]=dp[i][j]<dp[i-1][j-1]+1?dp[i][j]:dp[i-1][j-1]+1; 30 } 31 } 32 printf("%d\n",dp[n][m]); 33 } 34 return 0; 35 }