15、TSA数据上传（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tsaguide/#SP）

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tsa/

         https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tsaguide                                                 ###TSA提交流程

         https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tbl2asn2/                                                ###

         ftp://ftp.ncbi.nih.gov/toolbox/ncbi_tools/converters/by_program/tbl2asn/          ###tbl2asn工具下载页面，有win,linux版本

         https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK53709/#gbankquickstart.Submission_using_tbl2asn

         https://wenku.baidu.com/view/1fac238f4431b90d6d85c750.html

         http://downloads.asperasoft.com/

1、SUBMITTER

      提交者的一些信息

2、GENE INFO

     1):bioproject           PRJNA395283

      2):biosample         SAMN07374786   SAMN07374806 

     3):SRA run accession

           SRR5877206,SRR5877205,

           SRR5877204,SRR5877203

      4):assembly metadata

          assembly method                             #组装方法

          version or data program was run     #版本

          description of assembly method      #组装方法描述

          sequencing technology                    #测序平台

3、FILE       

        file type (默认)

       TSA submitter guide       #进入界面链接

                 structured comment template           #填写组装结构信息并下载    assembly.cmt           https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/structcomment/nongenomes/

                 template.stb                                     #联系人和数据所有者并下载   template.sbt            https://www.ncbi.nlm.nih.gov/WebSub/template.cgi

                                Reference title（文章）   ：       

                                Publication status：A.Unpublished   B.In-press   C.Published

 

4、SEQUENCE

          上传*.sqn文件

          tbl2asn -t *.sbt -i *.fa -w *.cmt -M t -a s -j "[organism=...][moltype=mRNA][SRA=SRR...,SRR...][tech=TSA]"   具体参数根据实际情况填写,所给文件名一定要与文件夹中文件名字一致，且不能有空格，空格用_代替。