centos安装hdf5数据相关的h5py包

0. 假设pip工具已经安装好了,然后使用pip install numpy和pip install numpy安装基本环境。

1. 在网站 ftp://ftp.hdfgroup.org/HDF5/current/src 下载hdf5的包,我下的是hdf5-1.8.16.tar这个95.9M的。

2. 解压安装 $ tar -zxf hdf5-1.8.16.tar.gz。

$ cd hdf5-1.8.16
$ ./configure --prefix=/usr/local/hdf5
$ sudo make
$ sudo make check                # run test suite.
$ sudo make install
$ sudo make check-install        # verify installation.

3. 执行pip install h5py。网上说这样安装到出现Successfully install h5py. Cleaning up…就装好了,然而我本人遇到了很多问题。

4. 首先是下述两行错误,提示nose版本不够。 

    pkg_resources.VersionConflict: (nose 0.10.4 (/usr/lib/python2.6/site-packages), Requirement.parse('nose>=1.0'))

    Command python setup.py egg_info failed with error code 1 in /tmp/pip-build-ohadfel/h5py

5. 在网站 http://pypi.python.org/packages/source/n/nose/nose-1.0.0.tar.gz#md5=47a4784c817afa6ef11a505b574584ed 下载nose1.0.0版本,安装。

   $ tar xzvf nose-1.0.0.tar.gz

   $ python setup.py install

6. 在执行pip install h5py提示我 ImportError: No module named Cython.Build。

7. 查了一下先执行pip install cython,然后执行pip install h5py。

8. 然后是提示unittest错误,安装unittest2-1.1.0.tar.gz。

9. 安装unittest还会出错,需要 

    pip install --upgrade pbr

10. 然后终于可以了




posted @ 2016-02-26 18:01  kisstea  阅读(2827)  评论(0编辑  收藏  举报