温馨咖啡小屋

摘要： 番茄工作法是弗朗切斯科•齐立罗(Francesco Cirillo)经过长时间学习习惯的探索后于1992年创立。齐立罗在罗马就读时，他在坚持中挣扎，于是决定挑战自己专注力，他使用手头上现有的一个形状似番茄的厨房定时器，那就是第一个番茄计时器（Pomodoro是意大利语中的番茄）。番茄工作法的使用步骤：每天开始的时候规划今天要完成的几项任务，将任务逐项写在列表里（或记在软件的清单里）设定你的番茄钟（定时器、软件、闹钟等），时间是25分钟开始完成第一项任务，直到番茄钟响铃或提醒（25分钟到）停止工作，并在列表里该项任务后画个X休息5分钟，活动、喝水、方便等等开始下一个番茄钟，继续该任务。一直循环下 阅读全文

摘要： 最近阅读了很多论文，都使用EndNote X5来管理，非常方便。开始觉得很麻烦，不过用多了便熟能生巧。毕竟为了将来写论文时管理参考文献方便点，现在多花点功夫也是值得的。这段时间我所用的方法都是手工输入，实在非常耗费时间。今天意外看到两篇文章讲如何将万方数据、知网、维普等常用数据库的论文信息导入EndNote，真是心下大喜。特转载于此。第一篇：《万方数据库的文献如何导入到endnote中》（文章来自科学网的马晓敏）在期刊检索界面，输入一个关键词，得到检索结果。在需要的检索结果前面打个勾，在结果界面的下面，有个“导出”，点击这个。然后有个验证码输入的过程。然后进入所导出的结果的界面。可以再次选择需 阅读全文

摘要： 今天遇到了一个问题，就是我明明安装了flash debugger却总是在Flash Builder中无法打开调试工具，说是什么无法连接。后来才发现，原因在于我的默认浏览器是chrome，而实际上是chrome不能调试flex。于是乎在网上搜索了一下问题原因和解决方案，整理如下：问题原因：chrome使用的是它内置的Flash Player，而这个并不是Debug版本，因此即使我们后来安装了新的debugger版本的flash player，依然无法正常使用。解决方案：在chrome中禁用内置版本，启用后来安装的debug版本，如下图：我的chrome里安装了三个flash player版本，第 阅读全文

摘要： 说明：本来以为这个视频教程内容整理是件很简单的事情，可是实际做起来才发现并不容易而且很耗费时间。精力所限，只做了下面简单的整理，请大家见谅。Video 1.01: Introducing Flex and the Adobe Flash Platform内容提要：了解Adobe Flash平台（Adobe FlashPlatform）及相关工具了解Flex框架和Flash Builder的新特性Adobe Flash Platform page上介绍了Adobe Flash平台上的众多工具和技术。上图展示了Adobe Flash平台上的技术与工具，以及它们各自扮演的角色和作用。Flash Bu 阅读全文

摘要： 推荐Flex的初学者学习Adobe官方提供的Flex in a Weekvideo series, Flex 4.5。这一系列教程虽然是英文视频，但是Adobe很贴心地给出了pdf格式的视频内容和源代码（在每一天的project file里），可以方便学习者对照阅读。 如果大家实在没有时间观看英文视频，那么可以简单阅读一下我的Flex学习笔记，我会翻译其中的部分内容并写下自己的总结和感受。希望对大家有所帮助。 这一系列视频主要介绍了Adobe Flex 4.5 framework以及如何使用Adobe Flash Builder 4.5来开发交互的数据驱动应用。所以视频中对... 阅读全文

摘要： 引言ChEBI——生物相关的化学实体（Chemical Entities of Biological Interest）——是诸如分子、离子这些化学实体以及它们在生物领域的角色所形成的本体。到2011年4月为止，它已经包含了总共大约25,000个类。这里，我们对本体中的最新发展和变化给出报告，并对影响未来变化的现有工作给予简要概括。1 最近变化1.1 映射顶级本体BFO为了遵照我们增加与生物领域其他本体互操作性的目标，ChEBI已经承担起提供对顶级本体BFO（Basic Formal Ontology）映射的任务。映射多种本体到一个常见的顶级本体之下使得我们更容易建立本体间的关联，因为它通过一 阅读全文

摘要： 摘要：胃肠道内窥镜领域可以由出于数据编码和数据集成目的的本体中获益。本文介绍了一些早前尝试基于OBO Foundry原则和已经存在的OBO Foundry本体而开发本体的结果。起初，本体仅用于表示实体和关系，而现在则隐式或硬编码于已存在的内窥镜报告系统的用户界面上。本体还被映射到已存在的数据库上以评估本体驱动查询的可行性。长期的目标是使本体发展为独立于应用的胃肠道内窥镜检查领域的术语学和信息模型。关键词：胃肠道内窥镜检查，知识表示，数据集成1 引言胃肠道内窥镜检查的实践引入了大量的结构化数据，这些数据都是由内窥镜检查报告中捕捉到的。为了保证数据收集的一致性，世界内窥镜检查组织为胃肠道内窥镜检查 阅读全文

摘要： 1 引言我们在Halo项目中的任务之一是根据进阶生物学教材的词汇表术语创建分类。Halo项目的目标是构建能够回答并解决广泛的科学学科中的新奇和高级问题的推理系统。为了实现这一目标，分类结果将被用作将生物教材中的段落翻译为推理系统所能操作的逻辑公式的基础。为了辅助展开我们的工作，我们输入2400个来自教材电子词汇表的词汇表术语和定义字符串到OWL格式的Collaborative Protege中作为类和常量字符串。我们的小组由生物学家和KR专家组成。我们采取了一种迭代的方式。小组中的生物学家进行初始的分类，限定subclass-of关系，并且加入他们所认为合适的其他类。与此同时，工作组会议中会确 阅读全文

摘要： 说明：由于我近期工作涉及生物本体，然而国内有关本体的时新文章较少，因此翻译ICBO2011会议的部分论文，与本体领域的研究者和爱好者分享。本人翻译水平有限，如果大家英文水平不错，还是推荐直接看原文。摘要：这里我们介绍owl_cpp(http://sf.net/projects/owl-cpp/)，它是一个开源的C++类库，用于对OWL2本体进行语法分析、查询和推理。owl_cpp使用Raptor、FaCT++和Boost类库。它用标准C++编写而成，因此在大部分的平台均可使用。owl_cpp执行严格的语法分析，能够检测出被其他语法分析器所忽略的错误。这一类库的另外一个优点就是它有很高的性能，并 阅读全文