摘要:
一、蛋白质相互作用的基本动力学 蛋白质之间的结合和解离可以用动力学参数来描述: 结合速率常数(k_on):表示蛋白质结合形成复合物的速度。 解离速率常数(k_off):表示复合物解离为单独蛋白质的速度。 解离常数(K_d = k_off / k_on):反映结合的亲和力,K_d越小,亲和力越强,解离 阅读全文
摘要:
参考 https://valdes-tresanco-ms.github.io/gmx_MMPBSA/dev/installation/ mpi4py和cupy的联合应用(anaconda环境):GPU-aware MPI + Python GPU arrays - Angry_Panda - 博客 阅读全文
摘要:
1. # coding=utf-8 import pandas as pd import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.model_selection import train_test_split from skl 阅读全文
摘要:
#usage python renumber.py -i xxx.pdb -a -r > new.pdb class Pdb(object): """ Object that allows operations with protein files in PDB format. """ def __ 阅读全文
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using gromacs to write a script for protein-protein complex moleculer dynamics from force field selection to trajectory analyze step by step,and give 阅读全文
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