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HDFS dfsclient读文件过程 源码分析

HDFS读取文件的重要概念

HDFS一个文件由多个block构成。HDFS在进行block读写的时候是以packet(默认每个packet为64K)为单位进行的。每一个packet由若干个chunk（默认512Byte）组成。Chunk是进行数据校验的基本单位，对每一个chunk生成一个校验和(默认4Byte)并将校验和进行存储。在读取一个block的时候，数据传输的基本单位是packet，每个packet由若干个chunk组成。

 

HDFS客户端读文件示例代码

FileSystem hdfs = FileSystem.get(new Configuration());
Path path = new Path("/testfile");// reading
FSDataInputStream dis = hdfs.open(path);
byte[] writeBuf = new byte[1024];
int len = dis.read(writeBuf);
System.out.println(new String(writeBuf, 0, len, "UTF-8"));
dis.close();

hdfs.close();

 

文件的打开

HDFS打开一个文件，需要在客户端调用DistributedFileSystem.open(Path f, int bufferSize)，其实现为：

public FSDataInputStream open(Path f, int bufferSize) throws IOException {
  return new DFSClient.DFSDataInputStream(
        dfs.open(getPathName(f), bufferSize, verifyChecksum, statistics));
}

其中dfs为DistributedFileSystem的成员变量DFSClient，其open函数被调用，其中创建一个DFSInputStream(src, buffersize, verifyChecksum)并返回。

DFSClient.DFSDataInputStream实现了HDFS的FSDataInputStream，里面简单包装了DFSInputStream，实际实现是DFSInputStream完成的。

在DFSInputStream的构造函数中，openInfo函数被调用，其主要从namenode中得到要打开的文件所对应的blocks的信息，实现如下：

synchronized void openInfo() throws IOException {
  LocatedBlocks newInfo = callGetBlockLocations(namenode, src, 0, prefetchSize);
  this.locatedBlocks = newInfo;
  this.currentNode = null;
}

private static LocatedBlocks callGetBlockLocations(ClientProtocol namenode,String src, long start, long length) throws IOException {
    return namenode.getBlockLocations(src, start, length);
}

LocatedBlocks主要包含一个链表的List<LocatedBlock> blocks，其中每个LocatedBlock包含如下信息：

  • Block b：此block的信息
  • long offset：此block在文件中的偏移量
  • DatanodeInfo[] locs：此block位于哪些DataNode上

上面namenode.getBlockLocations是一个RPC调用，最终调用NameNode类的getBlockLocations函数。

NameNode返回的是根据客户端请求的文件名字，文件偏移量，数据长度，返回文件对应的数据块列表，数据块所在的DataNode节点。

 

文件的顺序读取

 hdfs文件的顺序读取是最经常使用的.

文件顺序读取的时候，客户端利用文件打开的时候得到的FSDataInputStream.read(byte[] buffer, int offset, int length)函数进行文件读操作。

FSDataInputStream会调用其封装的DFSInputStream的read(byte[] buffer, int offset, int length)函数，实现如下：

public synchronized int read(byte buf[], int off, int len) throws IOException {
    ...
    if (pos < getFileLength()) {
    int retries = 2;
    while (retries > 0) {
      try {
        if (pos > blockEnd) {//首次pos=0,blockEnd=-1,必定调用方法blockSeekTo,初始化blockEnd,以后是读完了当前块，需要读下一个块，才会调用blockSeekTo
          currentNode = blockSeekTo(pos);//根据pos选择块和数据节点，选择算法是遍历块所在的所有数据节点，选择第一个非死亡节点
        }
        int realLen = Math.min(len, (int) (blockEnd - pos + 1));
        int result = readBuffer(buf, off, realLen);
        
        if (result >= 0) {
          pos += result;
        } else {
          throw new IOException("Unexpected EOS from the reader");
        }
        ...
        return result;
      } catch (ChecksumException ce) {
        throw ce;            
      } catch (IOException e) {
        ...
        if (currentNode != null) { addToDeadNodes(currentNode); }//遇到无法读的DataNode,添加到死亡节点
        if (--retries == 0) {//尝试读三次都失败，就抛出异常
          throw e;
        }
      }
    }
    }
    return -1;
}

 blockSeekTo函数会更新blockEnd,并创建对应的BlockReader,这里的BlockReader的初始化和上面的fetchBlockByteRange差不多，如果客户端和块所属的DataNode是同个节点，则初始化一个通过本地读取的BlockReader，否则创建一个通过Socket连接DataNode的BlockReader。

BlockReader的创建也是通过BlockReader.newBlockReader创建的，具体分析请看后面。

readBuffer方法比较简单，直接调用BlockReader的read方法直接读取数据。

BlockReader的read方法就根据请求的块起始偏移量，长度，通过socket连接DataNode，获取块内容，BlockReader的read方法不会做缓存优化。

 

文件的随机读取

对于MapReduce，在提交作业时，已经确定了每个map和reduce要读取的文件，文件的偏移量，读取的长度，所以MapReduce使用的大部分是文件的随机读取。

文件随机读取的时候，客户端利用文件打开的时候得到的FSDataInputStream.read(long position, byte[] buffer, int offset, int length)函数进行文件读操作。

FSDataInputStream会调用其封装的DFSInputStream的read(long position, byte[] buffer, int offset, int length)函数，实现如下：

public int read(long position, byte[] buffer, int offset, int length)throws IOException {  
  long filelen = getFileLength();
  int realLen = length;
  if ((position + length) > filelen) {
    realLen = (int)(filelen - position);
  }

  //首先得到包含从offset到offset + length内容的block列表
  //比如对于64M一个block的文件系统来说，欲读取从100M开始，长度为128M的数据，则block列表包括第2，3，4块block
  List<LocatedBlock> blockRange = getBlockRange(position, realLen);
  int remaining = realLen;
  //对每一个block，从中读取内容
  //对于上面的例子，对于第2块block，读取从36M开始，读取长度28M，对于第3块，读取整一块64M，对于第4块，读取从0开始，长度为36M，共128M数据
  for (LocatedBlock blk : blockRange) {
    long targetStart = position - blk.getStartOffset();
    long bytesToRead = Math.min(remaining, blk.getBlockSize() - targetStart);
    fetchBlockByteRange(blk, targetStart, targetStart + bytesToRead - 1, buffer, offset);
    remaining -= bytesToRead;
    position += bytesToRead;
    offset += bytesToRead;
  }
  ...return realLen;
}

getBlockRange方法根据文件的偏移量和长度，获取对应的数据块信息。主要是根据NameNode类的getBlockLocations方法实现，并做了缓存和二分查找等优化。

 fetchBlockByteRange方法真正从数据块读取内容，实现如下：

private void fetchBlockByteRange(LocatedBlock block, long start,long end, byte[] buf, int offset) throws IOException {
  Socket dn = null;
  int numAttempts = block.getLocations().length;
  //此while循环为读取失败后的重试次数
  while (dn == null && numAttempts-- > 0 ) {
    //选择一个DataNode来读取数据
    DNAddrPair retval = chooseDataNode(block);
    DatanodeInfo chosenNode = retval.info;
    InetSocketAddress targetAddr = retval.addr;
    BlockReader reader = null;
    int len = (int) (end - start + 1);
    try {

      if (shouldTryShortCircuitRead(targetAddr)) {
        //如果要读取的块所属的DataNode与客户端是同一个节点，直接通过本地磁盘访问，减少网络流量
        reader = getLocalBlockReader(conf, src, block.getBlock(),accessToken, chosenNode, DFSClient.this.socketTimeout, start);
      } else {
        //创建Socket连接到DataNode
        dn = socketFactory.createSocket();
        dn.connect(targetAddr, socketTimeout);
        dn.setSoTimeout(socketTimeout);
        //利用建立的Socket链接，生成一个reader负责从DataNode读取数据
        reader = BlockReader.newBlockReader(dn, src, block.getBlock().getBlockId(), accessToken,block.getBlock().getGenerationStamp(), start, len, buffersize, verifyChecksum, clientName);
      }        
      //读取数据
      int nread = reader.readAll(buf, offset, len);
      return;
    } finally {
      IOUtils.closeStream(reader);
      IOUtils.closeSocket(dn);
      dn = null;
    }
    //如果读取失败，则将此DataNode标记为失败节点
    addToDeadNodes(chosenNode);
  }
}

读取块内容，会尝试该数据块所在的所有DataNode，如果失败，就把对应的DataNode加入到失败节点，下次选择节点就会忽略失败节点(只在独立的客户端缓存失败节点，不上报到namenode)。

BlockReader的创建也是通过BlockReader.newBlockReader创建的，具体分析请看后面。

最后，通过BlockReader的readAll方法读取块的完整内容。

 

dfsclient和datanode的通信协议

dfsclient的连接

dfsclient首次连接datanode时，通信协议实现主要是BlockReader.newBlockReader方法的实现，如下：

public static BlockReader newBlockReader( Socket sock, String file,long blockId,long genStamp,long startOffset, long len,int bufferSize, boolean verifyChecksum,String clientName) throws IOException {

  //使用Socket建立写入流，向DataNode发送读指令
  DataOutputStream out = new DataOutputStream(
    new BufferedOutputStream(NetUtils.getOutputStream(sock,HdfsConstants.WRITE_TIMEOUT)));
  out.writeShort( DataTransferProtocol.DATA_TRANSFER_VERSION );
  out.write( DataTransferProtocol.OP_READ_BLOCK );
  out.writeLong( blockId );
  out.writeLong( genStamp );
  out.writeLong( startOffset );
  out.writeLong( len );
  Text.writeString(out, clientName);
  out.flush();
  //使用Socket建立读入流，用于从DataNode读取数据
  DataInputStream in = new DataInputStream(new BufferedInputStream(NetUtils.getInputStream(sock),bufferSize));
  short status = in.readShort();//块读取的状态标记，一般是成功
  DataChecksum checksum = DataChecksum.newDataChecksum( in );
  long firstChunkOffset = in.readLong();
  //生成一个reader，主要包含读入流，用于读取数据
  return new BlockReader( file, blockId, in, checksum, verifyChecksum,
                          startOffset, firstChunkOffset, sock );
}

这里的startOffset是相对于块的起始偏移量，len是要读取的长度。

DataChecksum.newDataChecksum(in),会从DataNode获取该块的checksum加密方式，加密长度。

BlockReader的readAll函数就是用上面生成的DataInputStream读取数据。

 下面是是读数据块时，客户端发送的信息：

version operator blockid generationStamp startOffset length clientName  accessToken

 

 

operator:byte Client所需要的操作，读取一个block、写入一个block等等
version:short Client所需要的数据与Datanode所提供数据的版本是否一致
blockId:long 所要读取block的blockId
generationStamp:long 所需要读取block的generationStamp
startOffset:long 读取block的的起始位置
length:long 读取block的长度
clientName:String Client的名字
accessToken:Token Client提供的验证信息，用户名密码等

 

DataNode对dfsclient的响应

DataNode负责与客户端代码的通信协议交互的逻辑，主要是DataXceiver的readBlock方法实现的：

private void readBlock(DataInputStream in) throws IOException {
  //读取指令
  long blockId = in.readLong();         
  Block block = new Block( blockId, 0 , in.readLong());
  long startOffset = in.readLong();
  long length = in.readLong();
  String clientName = Text.readString(in);

  //创建一个写入流，用于向客户端写数据
  OutputStream baseStream = NetUtils.getOutputStream(s,datanode.socketWriteTimeout);
  DataOutputStream out = new DataOutputStream(new BufferedOutputStream(baseStream, SMALL_BUFFER_SIZE));
  //生成BlockSender用于读取本地的block的数据，并发送给客户端
  //BlockSender有一个成员变量InputStream blockIn用于读取本地block的数据
  BlockSender blockSender = new BlockSender(block, startOffset, length,true, true, false, datanode, clientTraceFmt);
  out.writeShort(DataTransferProtocol.OP_STATUS_SUCCESS); // 发送操作成功的状态
  //向客户端写入数据
  long read = blockSender.sendBlock(out, baseStream, null);
  ……
  } finally {
    IOUtils.closeStream(out);
    IOUtils.closeStream(blockSender);
  }
}

 

DataXceiver的sendBlock用于发送数据，数据发送包括应答头和后续的数据包。应答头如下（包含DataXceiver中发送的成功标识）：

 

DataXceiver的sendBlock的实现如下：

long sendBlock(DataOutputStream out, OutputStream baseStream, 
                 BlockTransferThrottler throttler) throws IOException {
    ...
    try {
      try {
        checksum.writeHeader(out);//写入checksum的加密类型和加密长度
        if ( chunkOffsetOK ) {
          out.writeLong( offset );
        }
        out.flush();
      } catch (IOException e) { //socket error
        throw ioeToSocketException(e);
      }
      
      ...
      ByteBuffer pktBuf = ByteBuffer.allocate(pktSize);
      while (endOffset > offset) {//循环写入数据包
        long len = sendChunks(pktBuf, maxChunksPerPacket, 
                              streamForSendChunks);
        offset += len;
        totalRead += len + ((len + bytesPerChecksum - 1)/bytesPerChecksum*checksumSize);
        seqno++;
      }
      try {
        out.writeInt(0); //标记结束    
        out.flush();
      } catch (IOException e) { //socket error
        throw ioeToSocketException(e);
      }
    }
    ...
    return totalRead;
}

DataXceiver的sendChunks尽可能在一个packet发送多个chunk，chunk的个数由maxChunks和剩余的块内容决定，实现如下:

//默认是crc校验，bytesPerChecksum默认是512，checksumSize默认是4，表示数据块每512个字节，做一次checksum校验，checksum的结果是4个字节
private int sendChunks(ByteBuffer pkt, int maxChunks, OutputStream out) 
                         throws IOException {
    int len = Math.min((int) (endOffset - offset),bytesPerChecksum * maxChunks);//len是要发送的数据长度
    if (len == 0) {
      return 0;
    }

    int numChunks = (len + bytesPerChecksum - 1)/bytesPerChecksum;//这次要发送的chunk数量
    int packetLen = len + numChunks*checksumSize + 4;//packetLen是整个包的长度，包括包头，校验码，数据
    pkt.clear();
    
    // write packet header
    pkt.putInt(packetLen);//整个packet的长度
    pkt.putLong(offset);//块的偏移量
    pkt.putLong(seqno);//序列号
    pkt.put((byte)((offset + len >= endOffset) ? 1 : 0));//是否最后一个packet
    pkt.putInt(len);//发送的数据长度
    
    int checksumOff = pkt.position();
    int checksumLen = numChunks * checksumSize;
    byte[] buf = pkt.array();
    
    if (checksumSize > 0 && checksumIn != null) {
      try {
        checksumIn.readFully(buf, checksumOff, checksumLen);//填充chucksum的内容
      } catch (IOException e) {
        ...
      }
    }
    
    int dataOff = checksumOff + checksumLen;
    if (blockInPosition < 0) {
      IOUtils.readFully(blockIn, buf, dataOff, len);//填充块数据的内容
      if (verifyChecksum) {//默认是false,不验证
        //校验处理
      }
    }
    
    try {
      //通过socket发送数据到客户端
      
    } catch (IOException e) {
      throw ioeToSocketException(e);
    }
    ...
    return len;
}

数据组织成数据包来发送，数据包结构如下：

packetLen offset sequenceNum isLastPacket startOffset dataLen checksum   data

 

 

packetLen:int packet的长度，包括数据、数据的校验等等
offset:long packet在block中的偏移量
sequenceNum:long 该packet在这次block读取时的序号
isLastPacket:byte packet是否是最后一个
dataLen:int 该packet所包含block数据的长度，纯数据不包括校验和其他
checksum:该packet每一个chunk的校验和，有多少个chunk就有多少个校验和
data:该packet所包含的block数据

数据传输结束的标志，是一个packetLen长度为0的包。客户端可以返回一个两字节的应答OP_STATUS_CHECKSUM_OK(5)

 

dfsclient读取块内容

 hdfs文件的随机和顺序分析逻辑，都分析到BlockReader的readAll方法和read方法，这两个方法完成对数据块的内容读取。

而readAll方法最后也是调用read方法，所以这里重点分析BlockReader的read方法，实现如下:

public synchronized int read(byte[] buf, int off, int len) throws IOException {
      //第一次read, 忽略前面的额外数据
      if (lastChunkLen < 0 && startOffset > firstChunkOffset && len > 0) {
        int toSkip = (int)(startOffset - firstChunkOffset);
        if ( skipBuf == null ) {
          skipBuf = new byte[bytesPerChecksum];
        }
        if ( super.read(skipBuf, 0, toSkip) != toSkip ) {//忽略
          // should never happen
          throw new IOException("Could not skip required number of bytes");
        }
      }
      
      boolean eosBefore = gotEOS;
      int nRead = super.read(buf, off, len);
      // if gotEOS was set in the previous read and checksum is enabled :
      if (dnSock != null && gotEOS && !eosBefore && nRead >= 0
          && needChecksum()) {
        //checksum is verified and there are no errors.
        checksumOk(dnSock);
      }
      return nRead;
}

 

super.read即是FSInputChecker的read方法，实现如下

public synchronized int read(byte[] b, int off, int len) throws IOException {
   //参数检查
    int n = 0;
    for (;;) {
      int nread = read1(b, off + n, len - n);
      if (nread <= 0) 
        return (n == 0) ? nread : n;
      n += nread;
      if (n >= len)
        return n;
    }
}
//read1的len被忽略，只返回一个chunk的数据长度(最后一个chunk可能不足一个完整chunk的长度)
private int read1(byte b[], int off, int len)
  throws IOException {
    int avail = count-pos;
    if( avail <= 0 ) {
      if(len>=buf.length) {
        //直接读取一个数据chunk到用户buffer，避免多余一次复制
        //很巧妙，buf初始化的大小是chunk的大小，默认是512，这里的代码会在块的剩余内容大于一个chunk的大小时调用

        int nread = readChecksumChunk(b, off, len);
        return nread;
      } else {
        //读取一个数据chunk到本地buffer,也是调用readChecksumChunk方法
        //很巧妙，buf初始化大小是chunk的大小，默认是512，这里的代码会在块的剩余内容不足一个chunk的大小时进入调用

        fill();
        if( count <= 0 ) {
          return -1;
        } else {
          avail = count;
        }
      }
    }
    
    //从本地buffer拷贝数据到用户buffer，避免最后一个chunk导致数组越界
    int cnt = (avail < len) ? avail : len;
    System.arraycopy(buf, pos, b, off, cnt);
    pos += cnt;
    return cnt;    
}

 

FSInputChecker的readChecksumChunk会读取一个数据块的chunk，并做校验，实现如下:

//只返回一个chunk的数据长度(默认512，最后一个chunk可能不足一个完整chunk的长度)
private int readChecksumChunk(byte b[], int off, int len)
  throws IOException {
    // invalidate buffer
    count = pos = 0;
          
    int read = 0;
    boolean retry = true;
    int retriesLeft = numOfRetries; //本案例中，numOfRetries是1，也就是说不会多次尝试
    do {
      retriesLeft--;

      try {
        read = readChunk(chunkPos, b, off, len, checksum);
        if( read > 0 ) {
          if( needChecksum() ) {//这里会做checksum校验
            sum.update(b, off, read);
            verifySum(chunkPos);
          }
          chunkPos += read;
        } 
        retry = false;
      } catch (ChecksumException ce) {
          ...
          if (retriesLeft == 0) {//本案例中，numOfRetries是1，也就是说不会多次尝试,失败了，直接抛出异常
            throw ce;
          }
          
          //如果读取的chunk校验失败，以当前的chunkpos为起始偏移量，尝试新的副本
          if (seekToNewSource(chunkPos)) {
            seek(chunkPos);
          } else {
            //找不到新的副本,抛出异常
            throw ce;
          }
        }
    } while (retry);
    return read;
}

 

readChunk方法由BlockReader实现，分析如下:

//只返回一个chunk的数据长度(默认512，最后一个chunk可能不足一个完整chunk的长度)
protected synchronized int readChunk(long pos, byte[] buf, int offset,int len, byte[] checksumBuf) throws IOException {
      //读取一个 DATA_CHUNK.
      long chunkOffset = lastChunkOffset;
      if ( lastChunkLen > 0 ) {
        chunkOffset += lastChunkLen;
      }
      
      //如果先前的packet已经读取完毕，就读下一个packet。
      if (dataLeft <= 0) {
        //读包的头部
        int packetLen = in.readInt();
        long offsetInBlock = in.readLong();
        long seqno = in.readLong();
        boolean lastPacketInBlock = in.readBoolean();
        int dataLen = in.readInt();
        //校验长度
        
        lastSeqNo = seqno;
        isLastPacket = lastPacketInBlock;
        dataLeft = dataLen;
        adjustChecksumBytes(dataLen);
        if (dataLen > 0) {
          IOUtils.readFully(in, checksumBytes.array(), 0,checksumBytes.limit());//读取当前包的所有数据块内容对应的checksum,后面的流程会讲checksum和读取的chunk内容做校验
        }
      }

      int chunkLen = Math.min(dataLeft, bytesPerChecksum); //确定此次读取的chunk长度，正常情况下是一个bytesPerChecksum(512字节)，当文件最后不足一个bytesPerChecksum,读取剩余的内容。
      
      if ( chunkLen > 0 ) {
        IOUtils.readFully(in, buf, offset, chunkLen);//读取一个数据块的chunk
        checksumBytes.get(checksumBuf, 0, checksumSize);
      }
      
      dataLeft -= chunkLen;
      lastChunkOffset = chunkOffset;
      lastChunkLen = chunkLen;
      ...
      if ( chunkLen == 0 ) {
        return -1;
      }
      return chunkLen;
}

 

总结

 本文前面概要介绍了dfsclient读取文件的示例代码，顺序读取文件和随机读取文件的概要流程，最后还基于dfsclient和datanode读取块的过程，做了一个详细的分析。

 参考 http://caibinbupt.iteye.com/blog/284979

        http://www.cnblogs.com/forfuture1978/archive/2010/11/10/1874222.html

posted on 2013-02-19 13:22  ggjucheng  阅读(7303)  评论(1)  编辑  收藏  举报