【leetcode】Repeated DNA Sequences(middle)★

All DNA is composed of a series of nucleotides abbreviated as A, C, G, and T, for example: "ACGAATTCCG". When studying DNA, it is sometimes useful to identify repeated sequences within the DNA.

Write a function to find all the 10-letter-long sequences (substrings) that occur more than once in a DNA molecule.

For example,

Given s = "AAAAACCCCCAAAAACCCCCCAAAAAGGGTTT",

Return:
["AAAAACCCCC", "CCCCCAAAAA"].

思路:

开始用hash表存储所有出现过一次的字符串,结果空间超了。 有用最简单的循环,时间又超了。 做不出来,看答案。

大神的方法,思路是用一个整数来表示一个10字符长的字符串,相当于给字符串编码了。每个字母用一个 2位的二进制数表示 依次把每位对应的数字左移,后面或上新的表示数字。

//大神的方法 思路是用一个整数来表示一个10字符长的字符串 相当于给字符串编码了
    vector<string> findRepeatedDnaSequences3(string s) {
        unordered_set<int> words;
        vector<string> ans;
        char* map = new char[26];
        map['A' - 'A'] = 0;  //A C G T 分别用二进制数 00 01 10 11表示
        map['C' - 'A'] = 1;
        map['G' - 'A'] = 2;
        map['T' - 'A'] = 3;

        for(int i = 0; i + 9 < s.length(); i++) //遍历所有起始位置 注意!!! 必须写成i + 9 < s.length() 不能写成 s.length() - 9, 因为s.length()-9为负数时会被当做是大正数,即并没有用负数来表示。 可能是s.length()是无符号数的原因
        {
            int v = 0;
            for(int j = i; j < i + 10; j++)
            {
                //对于一个字符串,每一个字母对应一个两位的二进制数 每次把数字左移两位 留出新的空位来放新字母对应的数
                v <<= 2; 
                v |= map[s[j] - 'A'];
            }
            //如果数字已经出现过,并且还没有被放入答案中,压入答案
            if(words.find(v) != words.end() && find(ans.begin(), ans.end(), s.substr(i, 10)) == ans.end()) 
            {
                ans.push_back(s.substr(i, 10));
            }
            else
            {
                words.insert(v);
            }
        }

        return ans;
    }

 

我的两个通不过的方法

//hash表 内存超了
    vector<string> findRepeatedDnaSequences(string s) {
        vector<string> ans;
        unordered_set<string> hash;
        
        if(s.length() < 10) return ans;

        for(int i = 0; s.length() - i - 1 >= 10; i++)
        {
            string sub = s.substr(i, 10);
            if(find(ans.begin(), ans.end(), sub) != ans.end())
            {
                continue;
            }
            if(hash.count(sub) == 0)
            {
                hash.insert(sub);
            }
            else
            {
                hash.erase(sub);
                ans.push_back(sub);
            }
        }
        return ans;

    }

    //简单的查找法 时间超了
    vector<string> findRepeatedDnaSequences2(string s) {
        vector<string> ans;
        if(s.length() < 10) return ans;

        for(int i = 0; s.length() - i - 1 >= 10; i++)
        {
            string sub = s.substr(i, 10);
            if(find(ans.begin(), ans.end(), sub) != ans.end())
            {
                continue;
            }
            else if(s.find(sub, i + 1) != s.npos)
            {
                ans.push_back(sub);
            }
        }

        return ans;
    }

    //大神的方法 思路是用一个整数来表示一个10字符长的字符串 相当于给字符串编码了
    vector<string> findRepeatedDnaSequences3(string s) {
        unordered_set<int> words;
        vector<string> ans;
        char* map = new char[26];
        map['A' - 'A'] = 0;  //A C G T 分别用二进制数 00 01 10 11表示
        map['C' - 'A'] = 1;
        map['G' - 'A'] = 2;
        map['T' - 'A'] = 3;

        for(int i = 0; i + 9 < s.length(); i++) //遍历所有起始位置
        {
            int v = 0;
            for(int j = i; j < i + 10; j++)
            {
                //对于一个字符串,每一个字母对应一个两位的二进制数 每次把数字左移两位 留出新的空位来放新字母对应的数
                v <<= 2; 
                v |= map[s[j] - 'A'];
            }
            //如果数字已经出现过,并且还没有被放入答案中,压入答案
            if(words.find(v) != words.end() && find(ans.begin(), ans.end(), s.substr(i, 10)) == ans.end()) 
            {
                ans.push_back(s.substr(i, 10));
            }
            else
            {
                words.insert(v);
            }
        }

        return ans;
    }

 

posted @ 2015-03-05 10:51  匡子语  阅读(252)  评论(0编辑  收藏  举报