摘要:
查看包依赖关系: 1.在更新包之前,使用以下命令查看包的依赖: tools::package_dependencies("包名", db = installed.packages()) 这可以帮助你了解哪些包依赖于你要更新的包。 2.使用虚拟环境: 类似于Python的virtualenv,你可以使 阅读全文
摘要:
# 参考1:https://github.com/digitalcytometry/cytotrace2?tab=readme-ov-file # 参考2:http://www.360doc.com/content/24/0426/09/65403234_1121488444.shtml devto 阅读全文
摘要:
https://mp.weixin.qq.com/s/hlK1BB97giRpZAq9YvUKpQ 阅读全文
摘要:
###### ssGSEA ############## #加载18条神经通路合集 load("./score/ssGSEA/geneset_list_18.RData") geneset_list select_pathway_name <- c("G_protein_coupled_ACh_re 阅读全文
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###单个【循环版--晚点补充】 ## score定义 Cholinergic.score =list(c("Ache","Chat", "Chrm1", "Chrm3", "Chrna1", "Chrna2","Chrna4","Chrna5", "Chrna7","Chrna9", "Chrna 阅读全文
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####conda install pyscenic conda create -n pyscenic python=3.7 conda activate pyscenic conda install -y numpy conda install -y conda-forge::cytoolz #- 阅读全文
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library(dplyr) library(stringr) setwd("D:\workspace\ouyang\七七八八\基因求交集20241116") data1 <- read.csv("miRDB.汇总.csv",header=T,stringsAsFactors = FALSE) da 阅读全文
摘要:
教程:https://lishensuo.github.io/posts/bioinfo/008单细胞分析工具--monocle轨迹分析/ 关于monocle包的安装(20230311) 最近使用monocle包的orderCells() 函数出现了问题,发现有人已在github提出了相应的解决方案 阅读全文
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用conflicted包解决 参考:https://blog.csdn.net/qazplm12_3/article/details/119621588 #1 安装软件包 install.packages("conflicted") #2 显示冲突的包 library(conflicted) con 阅读全文
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参考:https://www.jianshu.com/p/9850c4d88a67 # 1.以pbmc3k为例,加载Seurat数据+设置工作目录 ##### setwd("/public/home/chidm/test/Gene相关性") load("/public/home/chidm/test 阅读全文