mfix mpi并行死锁问题探究

目前还没找到具体原因，只能先记录一下。（问题原因找到了）

分别用ubuntu14.04和ubuntu16.04测试，用的是笔记本，笔记本为双核四线程，用2线程并行计算；发现ubuntu16.04会在0.28057s时刻出现死锁，而ubuntu14.04在0.28057s时刻则会出现掉线程的问题：

上面是ubuntu16.04

上面是ubuntu14.04

 

但是，ubuntu16.04如果继续计算，会在后面依然出现死锁的情况，而ubuntu14.04继续计算以后则不会出现问题。

 

对于新安装的win10系统，ubuntu只有16.04版本，无法再安装14.04，经过尝试，发现可以选择debian作为替代，商店里搜索WSL就能看到，看起来debian似乎更加稳定一些。所有编译工具也推荐都用命令安装的版本，并且由于debian默认python和ssh是不安装的，记得手动安装，下面这些安装命令依次执行即可：

sudo apt install gcc gfortran make g++
sudo apt install libopenmpi-dev openmpi-bin # For DMP
sudo apt-get install python #debian和ubuntu有时候默认不安装
sudo apt-get install ssh #debian默认不安装

 

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2018.4.16

今天增大反应速率计算又出现掉线程的问题，于是在追踪问题的过程中发现一些技巧。

为了在一次掉线程以后快速复现问题，可以把dat里的RES_DT设置小一些，比如0.001。因为*.RES文件是用来给restart的时候用的，如果保存太大，restart的时候可能得从很久之前开始算。

通过反复restart，发现每次都在0.28s左右出现掉线程的问题，而且并没有不收敛相关错误。但是还是下意识把步长从0.0001改为0.00005，发现居然度过了那一段出问题的区间。问题解决！！

The devil is in the detail.